RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 CBLCQ9ULV8 474 aa6.51□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 A0A0U1RQV5 110 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF726A6NNF4 738 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 FRS3O43559 492 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 LIPFP07098 398 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 CPMP14384 443 aa6.5□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 BATFQ16520 125 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.5□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 C2orf72A6NCS6 295 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 A6NNC1 897 aa6.5□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 HLA-DPB1P04440 258 aa6.5□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 GAS1P54826 345 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 RAB38P57729 211 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 RAP1AP62834 184 aa6.5□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 MEF2DQ14814 521 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.5□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.5□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 CACNA1BQ00975 2339 aa6.5□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 H3BN98 237 aa6.49□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 FOXS1O43638 330 aa6.49□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.49□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.49□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 SFTA3P0C7M3 94 aa6.49□□□□□ -1.37
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ROBO1-211ENST00000498428 SYPL1Q16563 259 aa6.49□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 SYT14P1Q58G82 188 aa6.49□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.49□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 OR10K2Q6IF99 312 aa6.49□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.49□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.49□□□□□ -1.37
ROBO1-211ENST00000498428 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.49□□□□□ -1.37
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