RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	CXCL13	O43927	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	GLCE	O94923	617 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	IFNG	P01579	166 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SBK2	P0C263	348 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SELL	P14151	372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF24	P17028	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	DCK	P27707	260 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	TGFBR2	P37173	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	STAR	P49675	285 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CAMP	P49913	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	F2RL1	P55085	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CDH11	P55287	796 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	RBPJ	Q06330	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	STK11	Q15831	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	TEX30	Q5JUR7	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	GPR137	Q96N19	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2M2	Q96R28	347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	COPS4	Q9BT78	406 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SYT4	Q9H2B2	425 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	MED29	Q9NX70	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1W2PRG6	482 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717		A6NIZ1	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717		A8MXE2	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717		H7C1C5	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	LRRTM2	O43300	516 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	AQP8	O94778	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB36	O95755	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CLDN1	O95832	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CLPTM1	O96005	669 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	LALBA	P00709	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	PTH	P01270	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	OPN1LW	P04000	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	GYPB	P06028	91 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	RNF224	P0DH78	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	TFPI	P10646	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	EDNRA	P25101	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ACVR1B	P36896	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CA7	P43166	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CENPA	P49450	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ETV1	P50549	477 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2B6	P58173	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	RAP1B	P61224	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	LCN6	P62502	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	RAP1A	P62834	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF85	Q03923	595 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	MELK	Q14680	651 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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