RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482517.5

MYCBP2-206, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene MYCBP2, Length 1,581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-206	ENST00000482517	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	4e-11	■■■■□ 22.8
MYCBP2-206	ENST00000482517	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517		A0A1W2PRG6	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517		G3V3Q6	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517		J3QLW9	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	TSPAN2	O60636	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	STX11	O75558	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	REM1	O75628	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	SNAPC5	O75971	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	GHRH	P01286	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	TF	P02787	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	HPX	P02790	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	THY1	P04216	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ALDOB	P05062	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	CRH	P06850	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	PRG2	P13727	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	NID1	P14543	1247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ZNF19	P17023	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ATF1	P18846	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ACVR1B	P36896	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	GDNF	P39905	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	CCR9	P51686	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ACTC1	P68032	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ACTA1	P68133	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	PRR5	P85299	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ACKR1	Q16570	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517		Q6ZTK2	550 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	OR52D1	Q9H346	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	NANS	Q9NR45	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517		A0A0B4J203	849 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	SLC22A20	A6NK97	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517		H0YC42	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	BHLHE40	O14503	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	TOR1A	O14656	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	SC5D	O75845	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MYCBP2-206	ENST00000482517	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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