RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	CCL19	Q99731	98 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A0G2JK05	382 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A1W2PPK0	400 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	RGS5	O15539	181 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CXCL13	O43927	109 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CLDN15	P56746	228 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CARD18	P57730	90 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	OR10D3	Q8NH80	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ST7L	Q8TDW4	575 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PHYHIP	Q92561	330 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PERP	Q96FX8	193 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	C4orf45	Q96LM5	186 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	OR2M2	Q96R28	347 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	MRO	Q9BYG7	248 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ABCB9	Q9NP78	766 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	GLTP	Q9NZD2	209 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF879	B4DU55	563 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	INAFM1	C9JVW0	142 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	LINC01387	J3KSC0	135 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	MSTN	O14793	375 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PIN1P1	O15428	100 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	QDPR	P09417	244 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	MAGEB1	P43366	347 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CSNK1A1	P48729	337 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CCR9	P51686	369 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	KCNMB1	Q16558	191 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	WDR38	Q5JTN6	314 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM123	Q8N131	208 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	EMC7	Q9NPA0	242 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	NOX4	Q9NPH5	578 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	LRP12	Q9Y561	859 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364		V9GYH0	126 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	ACOD1	A6NK06	481 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM212	A6NML5	194 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	SIAH2	O43255	324 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	TMCC2	O75069	709 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	TNFSF13	O75888	250 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF432	O94892	652 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	PNP	P00491	289 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	CRH	P06850	196 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	NR2C1	P13056	603 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	RAB3B	P20337	219 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	CRYGS	P22914	178 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	CDA	P32320	146 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	THBS2	P35442	1172 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	LHX2	P50458	406 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	OR10A3	P58181	314 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	PPP3R1	P63098	170 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM27E3	Q08E93	113 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364		Q499Y3	187 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	CEP78	Q5JTW2	689 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	C10orf128	Q5T292	105 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	IDNK	Q5T6J7	187 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	DDI2	Q5TDH0	399 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	OR2A2	Q6IF42	318 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	MZT2A	Q6P582	158 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUBCN-208	ENST00000471364	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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