RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 AGR2O95994 175 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TFP02787 698 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 KLK1P06870 262 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ETFAP13804 333 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ABCD3P28288 659 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 EPHA2P29317 976 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FMO3P31513 532 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SOX6P35712 828 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IFNGR2P38484 337 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CAPZA2P47755 286 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 UGT2B15P54855 530 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CLDN20P56880 219 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ACSM1Q08AH1 577 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ST3GAL4Q11206 333 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GPR50Q13585 617 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM16LQ309B1 348 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ANKDD1AQ495B1 522 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR5M10Q6IEU7 315 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf94Q6P1W5 598 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GALNT5Q7Z7M9 940 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TMPRSS11BQ86T26 416 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ADCK1Q86TW2 530 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC190Q86UF4 302 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RNF130Q86XS8 419 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 STX19Q8N4C7 294 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CLDN22Q8N7P3 220 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MCFD2Q8NI22 146 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 BBS10Q8TAM1 723 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF675Q8TD23 568 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MS4A6EQ96DS6 147 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM80Q96HE8 168 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TPD52L3Q96J77 140 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 WDFY2Q96P53 400 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FAIM2Q9BWQ8 316 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 EBPLQ9BY08 206 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PTGES2Q9H7Z7 377 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MIEF1Q9NQG6 463 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MED17Q9NVC6 651 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CALML5Q9NZT1 146 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IFT52Q9Y366 437 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TENM3Q9P273 2699 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0A6YYD5 115 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CIB4A0PJX0 185 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C5orf63A6NC05 138 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 LRIT2A6NDA9 550 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DUXAA6NLW8 204 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 B9A039 149 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C5orf58C9J3I9 102 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PLPP1O14494 284 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FFAR1O14842 300 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 UGT2B17O75795 530 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GAS8-AS1O95177 125 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R3DO95685 299 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IL3P08700 152 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TRAPPC2P0DI81 140 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PSMB9P28065 219 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 AGTR1P30556 359 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 S100A5P33763 92 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINF1P36955 418 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MAP2K4P45985 399 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SLC6A8P48029 635 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CLK1P49759 484 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 KHKP50053 298 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MAPK12P53778 367 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CDH12P55289 794 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RAG2P55895 527 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CDK5Q00535 292 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SPOCK1Q08629 439 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PLCXD2Q0VAA5 305 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SLAMF1Q13291 335 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms