RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 SERPINF1P36955 418 aa16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC37A1P57057 533 aa16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 YPEL5P62699 121 aa16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 PEA15Q15121 130 aa16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP3K3Q99759 626 aa16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 OR8D2Q9GZM6 311 aa16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 NRSN2Q9GZP1 204 aa16.38■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 LMX1BO60663 402 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 NSA2O95478 260 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 HSD17B7P56937 341 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 OR52W1Q6IF63 320 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 CATSPERDQ86XM0 798 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 GVQW1Q8N7I0 195 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 DBX1A6NMT0 343 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 B4DGG1 531 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 C10orf142B7Z368 130 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 FABP1P07148 127 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 FOLR2P14207 255 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RIDAP52758 137 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 ROM1Q03395 351 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF260Q3ZCT1 412 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC22A6Q4U2R8 563 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 DRAM2Q6UX65 266 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 TMPPEQ6ZT21 453 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 MARCH3Q86UD3 253 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 GAL3ST4Q96RP7 486 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF122Q9H9V4 155 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 EMC9Q9Y3B6 208 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 SGCEO43556 437 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB5BP61020 215 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL27P61353 136 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 IGSF11Q5DX21 431 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC16A13Q7RTY0 426 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 MISPQ8IVT2 679 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 OR13C3Q8NGS6 347 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 CMBLQ96DG6 245 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 TPSD1Q9BZJ3 242 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 NMES1Q9C002 83 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 PRO3102Q9H379 93 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RHOFQ9HBH0 211 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 LPAR3Q9UBY5 353 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 CA14Q9ULX7 337 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 H0YIZ8 118 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 SMIM6P0DI80 62 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 ECH1Q13011 328 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM209BQ5JX69 171 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4D6Q8NGJ1 314 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 OR6S1Q8NH40 331 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF519Q8TB69 540 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 HRH4Q9H3N8 390 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 FN3KRPQ9HA64 309 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 DNASE1L1P49184 302 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 TSC22D1Q15714 1073 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFB119Q8N690 84 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 PTX4Q96A99 478 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RP1P56715 2156 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 MEGF11A6BM72 1044 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 HRH1P35367 487 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 CX3CR1P49238 355 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 CAV2P51636 162 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf100Q5SVJ3 147 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA0895LQ68EN5 471 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP54Q7Z3B4 507 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 LAT2Q9GZY6 243 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 COL6A3P12111 3177 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 BLACEA4D250 179 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 SRFP11831 508 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 CTSEP14091 401 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB6AP20340 208 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 SGCBQ16585 318 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM8Q8N371 416 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC6Q99741 560 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 MSGN1A6NI15 193 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms