RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375633.5

C6orf48-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-201ENST00000375633 GABRB1P18505 474 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 HSD11B1P28845 292 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 GCH1P30793 250 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 HTR1FP30939 366 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ATP6V1E1P36543 226 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 CX3CR1P49238 355 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ATP5J2P56134 94 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 TPTEP56180 551 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ECH1Q13011 328 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 EFNB3Q15768 340 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 PCK2Q16822 640 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ARL9Q6T311 187 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 FAM57BQ71RH2 274 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 SSX6Q7RTT6 188 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 KRT77Q7Z794 578 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 DTX2Q86UW9 622 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 OR5AS1Q8N127 324 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 NINJ1Q92982 152 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 SPTSSAQ969W0 71 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 CMBLQ96DG6 245 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 RNFT2Q96EX2 444 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ZNF799Q96GE5 643 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 DOK1Q99704 481 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 KCNJ15Q99712 375 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 APOL4Q9BPW4 351 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.69□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 MAST4O15021 2626 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 VPS13CQ709C8 3753 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ZNF878C9JN71 531 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 SPRY3O43610 288 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 SSX4O60224 188 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 GNAO1P09471 354 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 LYNX1P0DP58 116 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ZNF250P15622 560 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ALOX5APP20292 161 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 OPRL1P41146 370 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 AQP4P55087 323 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 CXCR4P61073 352 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 PSG7Q13046 419 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 GGTLC2Q14390 218 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 CARTPTQ16568 116 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 OCLNQ16625 522 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 Q5PR19 223 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ZNF691Q5VV52 312 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 OR2T2Q6IF00 324 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 USP51Q70EK9 711 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 APH1BQ8WW43 257 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 RFKQ969G6 155 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 MBD6Q96DN6 1003 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ADI1Q9BV57 179 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 MSL2Q9HCI7 577 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 CLN6Q9NWW5 311 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-201ENST00000375633 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms