RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 AICDAQ9GZX7 198 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SYT4Q9H2B2 425 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 XKR8Q9H6D3 395 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RHOFQ9HBH0 211 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RAB18Q9NP72 206 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PARP11Q9NR21 331 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DAPP1Q9UN19 280 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf170A2RU37 121 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 COLCA2A8K830 154 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PPM1DO15297 605 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD16AO95870 558 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ACTL6AO96019 429 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TNFP01375 233 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 IFNA6P05013 189 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CD37P11049 281 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LYL1P12980 280 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PRF1P14222 555 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 AGAP20933 346 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SDHBP21912 280 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 HTR2CP28335 458 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CD1CP29017 333 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SOX2P48431 317 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PNLIPRP2P54317 469 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ATP1B3P54709 279 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DNLZQ5SXM8 178 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LEG1Q6P5S2 330 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZSR6 202 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF627Q7L945 461 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 KDM8Q8N371 416 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ARL14Q8N4G2 192 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 AQP10Q96PS8 301 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TINAGQ9UJW2 476 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DHDHQ9UQ10 334 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM72A0PK05 275 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 C5orf51A6NDU8 294 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PRR19A6NJB7 356 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00587B1AMM8 73 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PEX12O00623 359 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LDB3O75112 727 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 IFNA17P01571 189 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PGAM2P15259 253 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 GABRA3P34903 492 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGDIBP52566 201 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN2P57739 230 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RHEBQ15382 184 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF141Q15928 474 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 FAM166AQ6J272 317 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NAA40Q86UY6 237 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 STX12Q86Y82 276 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 C1QL4Q86Z23 238 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 C4orf45Q96LM5 186 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 INTS14Q96SY0 518 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MICU1Q9BPX6 476 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CHST6Q9GZX3 395 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 IL21RQ9HBE5 538 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 FGF22Q9HCT0 170 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 EYSQ5T1H1 3165 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.42□□□□□ -1.38
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