RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363574.1

RNU6-1339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1339, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1339P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM94Q12767 1356 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ASTN1O14525 1302 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 YKT6O15498 198 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 APOA1P02647 267 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HLA-DPB1P04440 258 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CCL2P13500 99 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PSMC3P17980 439 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CCNOP22674 350 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HTR2CP28335 458 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HOXA9P31269 272 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HCAR3P49019 387 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UBE2AP49459 152 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UBE2E1P51965 193 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AP1S2P56377 157 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TAS2R39P59534 338 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PAFAH1B2P68402 229 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MPPED2Q15777 294 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 COX18Q8N8Q8 333 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 WDR31Q8NA23 367 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR11H7Q8NGC8 314 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LILRB4Q8NHJ6 448 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ABHD3Q8WU67 409 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ASZ1Q8WWH4 475 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RCN3Q96D15 328 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BTN2A3PQ96KV6 586 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZIM3Q96PE6 472 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 REEP1Q9H902 201 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ANKHQ9HCJ1 492 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MED4Q9NPJ6 270 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NEU3Q9UQ49 428 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SBNO1A3KN83 1393 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CARMIL3Q8ND23 1372 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 A0A0J9YXV3 536 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PDZK1P1A8MUH7 402 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KLLNB2CW77 178 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 K7ERQ8 282 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 VAPBO95292 243 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LCA5LO95447 670 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC25A27O95847 323 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NPPAP01160 153 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BCHEP06276 602 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GLAP06280 429 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CTSLP07711 333 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LCN1P31025 176 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MYCNOSP40205 109 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR2B8PP59922 312 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CACNG7P62955 275 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ERCC8Q13216 396 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 VAMP3Q15836 100 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ATP6V1FQ16864 119 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 Q8N976 141 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GPR26Q8NDV2 337 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GLT1D1Q96MS3 346 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NOX3Q9HBY0 568 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF302Q9NR11 478 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RGS18Q9NS28 235 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 STMN3Q9NZ72 180 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GGA2Q9UJY4 613 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GTF3C1Q12789 2109 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PALLDQ8WX93 1383 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PIK3R4Q99570 1358 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 A0A0B4J2E0 115 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR6C74A6NCV1 312 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RP2O75695 350 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GCGP01275 180 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ADRB3P13945 408 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TCN2P20062 427 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CD151P48509 253 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NDUFA8P51970 172 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SYNJ2BPP57105 145 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TNNC1P63316 161 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC35B1P78383 322 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms