RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 ATP1B3P54709 279 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 OR52W1Q6IF63 320 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 GVQW1Q8N7I0 195 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 OR5D14Q8NGL3 314 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 C11orf40Q8WZ69 217 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 SEC22AQ96IW7 307 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 CHRDQ9H2X0 955 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 FANCFQ9NPI8 374 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 KLHL13Q9P2N7 655 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 PISDQ9UG56 409 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 ADAMTS20P59510 1910 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 LOC100509620A0A075B734 347 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PNV4 684 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 APOC3P02656 99 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 CLDN6P56747 220 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 FBXW4P57775 412 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 CFHR1Q03591 330 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF529Q6P280 563 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 CFAP77Q6ZQR2 320 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 OR52H1Q8NGJ2 320 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 THAP6Q8TBB0 222 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 AIFM2Q9BRQ8 373 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 MOB1AQ9H8S9 216 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 TAS2R3Q9NYW6 316 aa16.23■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 VSTM2BA6NLU5 285 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 CASRP41180 1078 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 BIDP55957 195 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 NXPH1P58417 271 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 FOXF1Q12946 379 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF75AQ96N20 296 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 PTGES2Q9H7Z7 377 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 SEMA5BQ9P283 1151 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 USP34Q70CQ2 3546 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 LIPT2A6NK58 231 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 OR2AT4A6NND4 320 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 FAM25EA8MYX2 175 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 IFNA6P05013 189 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 VAMP1P23763 118 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 SLC22A6Q4U2R8 563 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 AWAT2Q6E213 333 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 OR2W3Q7Z3T1 314 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC36Q8IYA8 594 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 OR13C9Q8NGT0 318 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 OR10R2Q8NGX6 335 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 GAREM1Q9H706 876 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 VDAC3Q9Y277 283 aa16.22■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 BRWD1Q9NSI6 2320 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 C2orf72A6NCS6 295 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM14DPA8MWL7 114 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 SULT2B1O00204 365 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 TOR1AO14656 332 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 GNB3P16520 340 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 TAS2R31P59538 309 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 KMT5CQ86Y97 462 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 OR10S1Q8NGN2 331 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 SERINC1Q9NRX5 453 aa16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 PIAS2O75928 621 aa16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF20P17024 532 aa16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 LAP3P28838 519 aa16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PPIAP62937 165 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ELP2Q6IA86 826 aa16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 APCDD1LQ8NCL9 501 aa16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 FOXQ1Q9C009 403 aa16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TGIF2Q9GZN2 237 aa16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PCED1AQ9H1Q7 454 aa16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 FGF21Q9NSA1 209 aa16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 KCNK7Q9Y2U2 307 aa16.21■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 EFSO43281 561 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SSX5O60225 188 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 GP1BAP07359 652 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 BEX5Q5H9J7 111 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 THEM4Q5T1C6 240 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 COX15Q7KZN9 410 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 NUBPLQ8TB37 319 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PMEPA1Q969W9 287 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ARPC5LQ9BPX5 153 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 EMC6Q9BV81 110 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SELENOIQ9C0D9 397 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PIGMQ9H3S5 423 aa16.2■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MBD2Q9UBB5 411 aa16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms