RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 MTFR2Q6P444 385 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 COMMD2Q86X83 199 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 MDS2Q8NDY4 140 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SLC7A6Q92536 515 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 GGT3PA6NGU5 568 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 DHFRP00374 187 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CD46P15529 392 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 RAB3AP20336 220 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CCL1P22362 96 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 RFC3P40938 356 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 LHX2P50458 406 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 EFNB2P52799 333 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 GALK2Q01415 458 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 FAM57BQ71RH2 274 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 DOK3Q7L591 496 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 LRRC18Q8N456 261 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 MEIOBQ8N635 442 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 TMEM45BQ96B21 275 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 PGAM5Q96HS1 289 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 GPR84Q9NQS5 396 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 NCKAP5O14513 1909 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ARGFXA6NJG6 315 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 FAM166BA8MTA8 275 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 TCRBP04435 133 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CST2P09228 141 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SLC2A1P11166 492 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 MAGEA5P43359 124 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 MEOX1P50221 254 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SOX8P57073 446 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 PGAP1Q75T13 922 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 PTX4Q96A99 478 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.96□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 MED12Q93074 2177 aa14.96□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 SYNGR4O95473 234 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 MT-ND4P03905 459 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 GABRA1P14867 456 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 GIFP27352 417 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 ZNF529Q6P280 563 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 LYPD6Q86Y78 171 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 SPTSSAQ969W0 71 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 CRLF2Q9HC73 371 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 A0A0A6YYH2 397 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 CIB4A0PJX0 185 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 A6NJ64 397 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 A6NL46 340 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 CELA3AP09093 270 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 ZNF708P17019 499 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 RAB6AP20340 208 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 CLDN18P56856 261 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 RAB35Q15286 201 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 BCL2A1Q16548 175 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 NUDT15Q9NV35 164 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 MED13Q9UHV7 2174 aa14.94□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 A0A0U1RQV5 110 aa14.93□□□□□ -0.02
SSR4-201ENST00000320857 F5H5K5 113 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms