RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 U3KQK5 164 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 A6NLC8 198 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R3H8 397 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 F2RL2O00254 374 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 UBDO15205 165 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MLNRO43193 412 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GMDSO60547 372 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TPST2O60704 377 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFPL1O95159 310 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 BGNP21810 368 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LMO1P25800 156 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SAA4P35542 130 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R41P59536 307 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GTDC1Q4AE62 458 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PGAP1Q75T13 922 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LYG1Q8N1E2 194 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SMYD1Q8NB12 490 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GJC3Q8NFK1 279 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LIPHQ8WWY8 451 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2H4Q92759 462 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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PGGT1B-201ENST00000296642 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 POFUT1Q9H488 388 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CTSZQ9UBR2 303 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPE2 198 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPH5 198 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PR64 198 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PRV1 198 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R1W7 72 aa6.44□□□□□ -1.38
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PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-DPB1P04440 258 aa6.44□□□□□ -1.38
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS4P56470 323 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CTXN1P60606 82 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LY6EQ16553 131 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP51A1Q16850 503 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM239Q8WW34 195 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LZICQ8WZA0 190 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 COQ7Q99807 217 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PALMDQ9NP74 551 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 EMC7Q9NPA0 242 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.44□□□□□ -1.38
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PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.43□□□□□ -1.38
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PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PQ09 198 aa6.43□□□□□ -1.38
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PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PRM7 423 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 M0QX08 132 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TYROBPO43914 113 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5F1O95221 314 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 THY1P04216 161 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CD28P10747 220 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GPX2P18283 190 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 POU1F1P28069 291 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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