RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 FOXK2Q01167 660 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 C5orf46Q6UWT4 87 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 OR13C2Q8NGS9 318 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 OR5J2Q8NH18 312 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 MRGPRX4Q96LA9 322 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 DERL3Q96Q80 235 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM6P0DI80 62 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 RPA2P15927 270 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 CBR1P16152 277 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 PYCR1P32322 319 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 LNX2Q8N448 690 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SLC39A7Q92504 469 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 PGLYRP3Q96LB9 341 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFB6O95139 128 aa18.08■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 RLN1P04808 185 aa18.08■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 GYPBP06028 91 aa18.08■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 S100A6P06703 90 aa18.08■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 PTGFRP43088 359 aa18.08■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF85Q03923 595 aa18.08■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SULT1C2O00338 296 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 CEACAM4O75871 244 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 MGMTP16455 207 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 CD53P19397 219 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 IL11P20809 199 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 DPP4P27487 766 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 ARG2P78540 354 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 FOXO1Q12778 655 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 C1QL3Q5VWW1 255 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 SSX6Q7RTT6 188 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 OR2AK2Q8NG84 335 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 RXFP4Q8TDU9 374 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 HAS2Q92819 552 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 RELTQ969Z4 430 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 DCBLD2Q96PD2 775 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 OR11A1Q9GZK7 315 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 PIGMQ9H3S5 423 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM138Q9NPI0 162 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 CHRNA9Q9UGM1 479 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 NCKAP5O14513 1909 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 ACACAQ13085 2346 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV27A0A087WT01 109 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 RAB19A4D1S5 217 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A31A6NKX4 558 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 CBR3O75828 277 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 SBK2P0C263 348 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 ADCYAP1P18509 176 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 HES5Q5TA89 166 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 RFLNBQ8N5W9 214 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 DNAAF1Q8NEP3 725 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 OR2M7Q8NG81 312 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 OR51A7Q8NH64 312 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 SMPDL3BQ92485 455 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJA3Q96EY1 480 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 FAM173AQ9BQD7 235 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 ADGRL4Q9HBW9 690 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 CMC2Q9NRP2 79 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 DKKL1Q9UK85 242 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 SIGLEC7Q9Y286 467 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 EFNA2O43921 213 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 NPIPB7O75200 414 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 F12P00748 615 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 RFPL3SP0C7P2 107 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 HCCSP53701 268 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 FHL1Q13642 323 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF74Q16587 644 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 OLFML2AQ68BL7 652 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 STK35Q8TDR2 534 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 TAAR8Q969N4 342 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB8AQ96BR9 441 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 MOGAT1Q96PD6 335 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 CSAG2Q9Y5P2 127 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 LAMA5O15230 3695 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 A0A087WZY1 265 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 SP1P08047 785 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 LUMP51884 338 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 CRMP1Q14194 572 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 IGFL2Q6UWQ7 119 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 SULF2Q8IWU5 870 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM185BQ9H7F4 350 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 INPP5EQ9NRR6 644 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 A8MVM7 634 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 NME2P1O60361 137 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 NME2P22392 152 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 LTBQ06643 244 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-201ENST00000265339 TEX19Q8NA77 164 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms