RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000056233.3

NFE2L3-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L3, Length 3,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3-201ENST00000056233 ARPC3O15145 178 aa15.18■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 GLRA1P23415 457 aa15.18■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 CCINQ13939 588 aa15.18■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 PRTGQ2VWP7 1150 aa15.18■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 FAM213BQ8TBF2 198 aa15.18■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 OR8B4Q96RC9 309 aa15.18■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 NICN1Q9BSH3 213 aa15.18■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.18■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 LINC01387J3KSC0 135 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 PGCP20142 388 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 RAB2AP61019 212 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 LINC01590Q5TEZ4 76 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 KLHDC3Q9BQ90 382 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TPSD1Q9BZJ3 242 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 CNTD2Q9H8S5 307 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 ESPL1Q14674 2120 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TLE1Q04724 770 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 OR2I1PQ8NGU4 316 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 SMCO4Q9NRQ5 59 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 CTSFQ9UBX1 484 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 CYCSP99999 105 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 VWA2Q5GFL6 755 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 FAM57BQ71RH2 274 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TMEM59Q9BXS4 323 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 NOTCH4Q99466 2003 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 MPTX1A8MV57 137 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 LILRB3O75022 631 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 CLRN1P58418 232 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 FNDC9Q8TBE3 224 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 PIGTQ969N2 578 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 LYRM4Q9HD34 91 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 MIOXQ9UGB7 285 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 A0A1W2PPH5 198 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 PHYHO14832 338 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 CSTBP04080 98 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 HLA-DOBP13765 273 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 OPRM1P35372 400 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 F2RL1P55085 397 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 C4orf17Q53FE4 359 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 RTN4RL2Q86UN3 420 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 GPX8Q8TED1 209 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 SPSB2Q99619 263 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 FBRSQ9HAH7 460 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 A0A1W2PPC1 479 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 MSGN1A6NI15 193 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 CYR61O00622 381 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 THEGLP0DJG4 465 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TMEM225BP0DP42 221 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 LY6G6FQ5SQ64 297 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 DNM1P34Q6PK57 102 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TMEM229BQ8NBD8 167 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 OR5D14Q8NGL3 314 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 FOXQ1Q9C009 403 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 OR5AC2Q9NZP5 309 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 PRSS37A4D1T9 235 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 WRBO00258 174 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 CDAP32320 146 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 RFC3P40938 356 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 ALG11Q2TAA5 492 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 OR5AP2Q8NGF4 316 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 BIDP55957 195 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 RPL27P61353 136 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 BRICD5Q6PL45 260 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 WDSUB1Q8N9V3 476 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 ASB5Q8WWX0 329 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 PGAM5Q96HS1 289 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 AUP1Q9Y679 476 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE2L3-201ENST00000056233 C1QL1O75973 258 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE2L3-201ENST00000056233 PJVKQ0ZLH3 352 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE2L3-201ENST00000056233 PDCD1Q15116 288 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE2L3-201ENST00000056233 PARM1Q6UWI2 310 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF440Q8IYI8 595 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE2L3-201ENST00000056233 PET100P0DJ07 73 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms