RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.07■□□□□ 0.16
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 C10orf67Q8IYJ2 551 aa16.03■□□□□ 0.16
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPRY3O43610 288 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AVPP01185 164 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM33P57088 247 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LMO4P61968 165 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FOXL1Q12952 345 aa16.02■□□□□ 0.16
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 TAF13Q15543 124 aa16.02■□□□□ 0.16
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