RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Crmp1P97427 572 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Htr1aQ64264 421 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 G6pc3Q6NSQ9 346 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MvdQ99JF5 401 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Neu3Q9JMH7 418 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ltbp1Q8CG19 1712 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1255A2AUA4 310 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CgaP01216 120 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rac1P63001 192 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1167Q7TR26 316 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ms4a6bQ99N09 244 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm43191F6YIH5 235 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lyz1P17897 148 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn1r6Q8R2D4 303 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Msantd3Q9CR78 275 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r117K7N6V1 857 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PipP02816 146 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Itgb2P11835 771 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc6a9P28571 692 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dlx5P70396 289 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1509Q7TQQ0 308 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr429Q7TRW1 312 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adamtsl4Q80T21 1036 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr137Q8VFC2 312 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ash2lQ91X20 623 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Glb1l3A2RSQ1 649 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm17728E9Q5K2 132 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsf1P38532 525 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sstr4P49660 385 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rims4P60191 269 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc46a3Q9DC26 460 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cln8Q9QUK3 288 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kcnj1O88335 372 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kcnk2P97438 426 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Masp1P98064 704 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnf150Q5DTZ6 437 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tas2r39Q7TQA5 319 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mfsd11Q8BJ51 449 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8C3I9 435 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem106aQ8VC04 261 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atg2bQ80XK6 2075 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Timp1P12032 205 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 2010315B03RikJ3QK55 433 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 S100a1P56565 94 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sgk494Q5SYL1 278 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Elavl4Q61701 385 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Opn4Q9QXZ9 521 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm15130F6PYN5 206 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tcstv3O70518 169 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cd209aQ91ZX1 238 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prss52Q9D9M0 321 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Akip1Q9JJR5 212 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 P2ry4Q9JJS7 361 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr789A0A1L1SV77 312 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 5430403G16RikD3Z5L4 667 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nt5c3bQ3UFY7 300 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dzank1Q8C008 778 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Med19Q8C1S0 244 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gkn3Q9D0T7 191 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TriobpQ99KW3 2014 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fabp5Q05816 135 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1340Q3KPC7 315 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem9Q9CR23 183 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem175Q9CXY1 499 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plag1Q9QYE0 499 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 RttnQ8R4Y8 2226 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam90a1aA2A4E2 429 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dpm1O70152 260 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Alox5apP30355 161 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gbx1P82976 418 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cr1lQ64735 483 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam122bQ6NZE7 255 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hamp2Q80T19 83 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nsa2Q9CR47 260 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 9930021J03RikH3BKP8 2027 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp109A0A0U1RPC5 652 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem44E9Q4M0 433 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gosr1O88630 250 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Csf3P09920 208 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MaoaQ64133 526 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Aqp6Q8C4A0 293 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Acer3Q9D099 267 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Med29Q9DB91 199 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Xylt2Q9EPL0 865 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sp6Q9ESX2 376 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kcns1O35173 497 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 RrasP10833 218 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr733Q14AK5 308 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zik1Q80YP6 463 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 IhhP97812 411 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Grb2Q60631 217 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PurgQ8R4E6 350 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr777Q8VFH3 311 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rab40bQ8VHP8 278 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppil3Q9D6L8 161 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r69G3XA45 850 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp955bL7N232 545 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ifna5P07349 189 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.3 ms