RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pmp2P24526 132 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RptnP97347 1118 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cdk2P97377 346 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Shc1P98083 579 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tcfl5Q32NY8 489 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Foxd3Q61060 465 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 OmgQ63912 440 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Smim12Q78RX3 92 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr524Q7TRU0 318 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 ClmQ7TSN2 230 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nanos1Q80WY3 267 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 TtpaQ8BWP5 278 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Neil1Q8K4Q6 389 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1342Q8VFY3 315 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 IcaQ9DBD0 700 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AspdhQ9DCQ2 287 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hebp2Q9WU63 205 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sirpb1bA0A0A6YXN8 397 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 6430628N08RikA0A0U1RQ45 177 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm45716A0A1B0GRQ0 93 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp54E9PW05 585 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn1r157E9Q069 297 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn1r139E9Q8L6 297 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccl17F6R5P4 103 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn1r112G3UY48 297 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sirpb1cK7N6K7 397 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prdx4O08807 274 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 ComtO88587 265 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fgf9P54130 208 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q149G0 166 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ceacam19Q3TQ88 271 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trp53rkaQ5U452 244 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cntn2Q61330 1040 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr517Q7TRU4 314 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmem184bQ8BG09 407 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp595Q8BIN6 625 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cpne1Q8C166 536 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Arl6ip5Q8R5J9 188 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 HpgdQ8VCC1 269 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr129Q8VEY1 330 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Camk1gQ91VB2 477 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mus81Q91ZJ0 551 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tp53rkQ99PW4 244 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Smg9Q9DB90 520 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 St6galnac5Q9QYJ1 336 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cpxm1Q9Z100 722 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm29797A0A140LIA7 188 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mn1D3YWE6 1297 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 TmppeD3Z286 447 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r10K7N621 847 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccrl2O35457 360 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ca11O70354 328 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Csn2P10598 231 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc45a2P58355 530 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sumo1P63166 101 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ikzf2P81183 526 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Adam8Q05910 826 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fthl17dQ3SXD1 176 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Psg19Q4KL31 475 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc5a10Q5SWY8 596 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr924Q7TRB8 308 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr884Q7TRE1 309 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Smad3Q8BUN5 425 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmem56Q8CGF5 276 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Uqcc3Q8K2T4 89 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rdh16f2Q8K3M1 318 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1232Q8VEX7 311 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1284Q8VF29 311 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1384Q8VFA8 318 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1155Q8VFR3 314 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Man2c1Q91W89 1039 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rap1bQ99JI6 184 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fthl17Q99MX2 176 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rnf2Q9CQJ4 336 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Xrcc3Q9CXE6 349 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 MeiobQ9D513 470 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Capns2Q9D7J7 247 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 C1qtnf3Q9ES30 246 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RhoaQ9QUI0 193 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Abhd1Q9QZC8 412 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Opn3Q9WUK7 400 aa8.49□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trav23A0A0G2JG17 115 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr316A0A0N4SVP2 306 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 MiipA2A7Y5 387 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp81B8JJZ7 531 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r32K7N686 852 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ldb2O55203 373 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 JchainP01592 159 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 B2mP01887 119 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 FasP25446 327 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dnase1P49183 284 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dbx1P52950 335 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NfkbidQ2TB02 327 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr318Q5NCD7 306 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc17a4Q5NCM1 492 aa8.48□□□□□ -1.05
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cyb561a3Q6P1H1 242 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.1 ms