Protein–RNA interactions for Protein: P49183

Dnase1, Deoxyribonuclease-1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnase1P49183 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Dnase1P49183 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnase1P49183 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnase1P49183 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnase1P49183 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnase1P49183 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnase1P49183 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnase1P49183 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnase1P49183 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnase1P49183 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Dnase1P49183 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnase1P49183 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnase1P49183 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnase1P49183 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dnase1P49183 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnase1P49183 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnase1P49183 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnase1P49183 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnase1P49183 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnase1P49183 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnase1P49183 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnase1P49183 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnase1P49183 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Dnase1P49183 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnase1P49183 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Dnase1P49183 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnase1P49183 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnase1P49183 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnase1P49183 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnase1P49183 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnase1P49183 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnase1P49183 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnase1P49183 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnase1P49183 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnase1P49183 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnase1P49183 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnase1P49183 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnase1P49183 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnase1P49183 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnase1P49183 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnase1P49183 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnase1P49183 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnase1P49183 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnase1P49183 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnase1P49183 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnase1P49183 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnase1P49183 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnase1P49183 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnase1P49183 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnase1P49183 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnase1P49183 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnase1P49183 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnase1P49183 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnase1P49183 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnase1P49183 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnase1P49183 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnase1P49183 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnase1P49183 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnase1P49183 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnase1P49183 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnase1P49183 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnase1P49183 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnase1P49183 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnase1P49183 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnase1P49183 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnase1P49183 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnase1P49183 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnase1P49183 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnase1P49183 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnase1P49183 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnase1P49183 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnase1P49183 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnase1P49183 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnase1P49183 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnase1P49183 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnase1P49183 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnase1P49183 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnase1P49183 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnase1P49183 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnase1P49183 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnase1P49183 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnase1P49183 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnase1P49183 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnase1P49183 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnase1P49183 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnase1P49183 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnase1P49183 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnase1P49183 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnase1P49183 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnase1P49183 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnase1P49183 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnase1P49183 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnase1P49183 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnase1P49183 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnase1P49183 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnase1P49183 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnase1P49183 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnase1P49183 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnase1P49183 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnase1P49183 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms