RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa24.55■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 CUBNO60494 3623 aa24.55■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 TVP23AA6NH52 213 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 RAP2AP10114 183 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 GGT2P36268 569 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 FBXW12Q6X9E4 464 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 PHC2Q8IXK0 858 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC37A3Q8NCC5 494 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 OR51L1Q8NGJ5 315 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 HCAR1Q9BXC0 346 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 C1orf21Q9H246 121 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 KCNG2Q9UJ96 466 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 SVEP1Q4LDE5 3571 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV2-5P01817 119 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 LCATP04180 440 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 SBK2P0C263 348 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 BHLHE23Q8NDY6 225 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2T33Q8NG76 320 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 ITLN1Q8WWA0 313 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM106BQ9NUM4 274 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 ARMC1Q9NVT9 282 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 DCAF16Q9NXF7 216 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 IL19Q9UHD0 177 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 GNGT2O14610 69 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 PLPP2O43688 288 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 CST1P01037 141 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 MALLQ13021 153 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC27A4Q6P1M0 643 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 LNX2Q8N448 690 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 OR8G5Q8NG78 346 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 OR10G2Q8NGC3 310 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2V2Q96R30 315 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 CHID1Q9BWS9 393 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 DGCR6LQ9BY27 220 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 METRNQ9UJH8 293 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 PCDHB10Q9UN67 800 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 BAIAP2Q9UQB8 552 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 NPTNQ9Y639 398 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 ACSM4P0C7M7 580 aa24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 RPS27P42677 84 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 TPTEP56180 551 aa24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 CRMP1Q14194 572 aa24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 LIPNQ5VXI9 398 aa24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 OR10AD1Q8NGE0 317 aa24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 OR13G1Q8NGZ3 307 aa24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 BCAS4Q8TDM0 211 aa24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 ST7LQ8TDW4 575 aa24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 SPTSSAQ969W0 71 aa24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 ACOT8O14734 319 aa24.5■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 GYG2O15488 501 aa24.5■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 PNPP00491 289 aa24.5■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 IFNGP01579 166 aa24.5■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 RBMXP38159 391 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4Q3Q8NH05 313 aa24.5■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 GIPC3Q8TF64 312 aa24.5■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 MAP6Q96JE9 813 aa24.5■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 DDOQ99489 341 aa24.5■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 OCEL1Q9H607 264 aa24.5■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 RIIAD1A6NNX1 92 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 H3BN98 237 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 GYPBP06028 91 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 SPARCP09486 303 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 SELEP16581 610 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 FMO3P31513 532 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC6A9P48067 706 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 PRSS12P56730 875 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 LYPD4Q6UWN0 246 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 NAA40Q86UY6 237 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 ADGRG5Q8IZF4 528 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF283Q8N7M2 679 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 TEX47Q8TBZ9 253 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNRF4Q8WWF5 429 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 OTULINQ96BN8 352 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A0G2JMP0 313 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A0X1KG70 313 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 DHRS12A0PJE2 317 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 TAF13Q15543 124 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 DNAL1Q4LDG9 190 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 COLCA1Q6ZS62 124 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 RFLNBQ8N5W9 214 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4M2Q8NGB6 313 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 OR6K6Q8NGW6 343 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 FEVQ99581 238 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa24.48■■□□□ 1.51
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM100Q9NV29 134 aa24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.7 ms