RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PRG6 482 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 PRSS37A4D1T9 235 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 LIPT2A6NK58 231 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 C9J4A7 227 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 RGS5O15539 181 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SEC14L5O43304 696 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SLC16A7O60669 478 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 HPGDSO60760 199 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SERPINI2O75830 405 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 STK17BO94768 372 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 IGHEP01854 428 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CD63P08962 238 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 UCHL1P09936 223 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 RAB40ALP0C0E4 278 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ZNF806P0C7X5 589 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CTLA4P16410 223 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 AHCYP23526 432 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 F8A1P23610 371 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 EDNRAP25101 427 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 MAGEB1P43366 347 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 EVX1P49640 407 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TMED10P49755 219 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 GDI2P50395 445 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 BCAP31P51572 246 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 RPS18P62269 152 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ACTA2P62736 377 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 PPP3R1P63098 170 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ACTG2P63267 376 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SNTA1Q13424 505 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 MELKQ14680 651 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OR7A5Q15622 319 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ZNF79Q15937 498 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 EXT1Q16394 746 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TRIM16LQ309B1 348 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 PLPPR5Q32ZL2 321 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CCDC58Q4VC31 144 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 DCAF12Q5T6F0 453 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OTPQ5XKR4 325 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 XKRXQ6PP77 449 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 RNF144BQ7Z419 303 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TPRA1Q86W33 373 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 MS4A15Q8N5U1 240 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OR5M1Q8NGP8 315 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OR6K6Q8NGW6 343 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 PAQR8Q8TEZ7 354 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CT55Q8WUE5 264 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 DDIT4LQ96D03 193 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SMIM19Q96E16 107 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CEP19Q96LK0 163 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 AMELYQ99218 206 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 GFI1Q99684 422 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CCDC32Q9BV29 185 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 NDEL1Q9GZM8 345 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SYT4Q9H2B2 425 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 METTL7AQ9H8H3 244 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 WDR76Q9H967 626 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ZNF160Q9HCG1 818 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TIGARQ9NQ88 270 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 POLE4Q9NR33 117 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 KLRF1Q9NZS2 232 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 COMMD3Q9UBI1 195 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 GNG8Q9UK08 70 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 PADI1Q9ULC6 663 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TBC1D24Q9ULP9 559 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 VDAC3Q9Y277 283 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.79□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 THADAQ6YHU6 1953 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SPTBP11277 2137 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PPK0 400 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 FABP12A6NFH5 140 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TP53I11O14683 189 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 GPRIN2O60269 458 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ZIC3O60481 467 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 PFDN1O60925 122 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OR6A2O95222 327 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SERPINA3P01011 423 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OPN1LWP04000 364 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CSF3P09919 207 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OR8G3PP0DMU2 310 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CCL3P10147 92 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TFPIP10646 304 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TCN2P20062 427 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms