RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 PMS2P1A4D2B8 440 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 LRP5LA4QPB2 252 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF92Q03936 586 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 VN1R4Q7Z5H5 301 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 SFTPA1Q8IWL2 248 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 ORAI1Q96D31 301 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 PRRG2O14669 202 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 XRCC2O43543 280 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 HBE1P02100 147 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 TLE4Q04727 773 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 AKR1C1Q04828 323 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC38A9Q8NBW4 561 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 KNTC1P50748 2209 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 RFX2P48378 723 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 HNF4GQ14541 408 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 HMGCLL1Q8TB92 370 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS23P62266 143 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 BAXQ07812 192 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 UFSP2Q9NUQ7 469 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PPE2 198 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PR64 198 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PRV1 198 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 GMDSO60547 372 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 CTXN2P0C2S0 81 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 CNR1P21554 472 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 NFYBP25208 207 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM27D1Q5T7N8 215 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 OR51A4Q8NGJ6 313 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 OR51H1Q8NH63 302 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 HIPK2Q9H2X6 1198 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 MMP25Q9NPA2 562 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 FOLR1P15328 257 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 B4GALT1P15291 398 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 SERPINF1P36955 418 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 OR10K2Q6IF99 312 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 ROBO4Q8WZ75 1007 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 ZG16BQ96DA0 208 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 REEP6Q96HR9 211 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 TAAR9Q96RI9 348 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 EGLN1Q9GZT9 426 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 GHRLQ9UBU3 117 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 S100A7AQ86SG5 101 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2V1Q8NHB1 315 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 KRBOX1C9JBD0 128 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 MBTPS2O43462 519 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC39A9Q9NUM3 307 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC187A0A096LP49 1063 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 GIPP09681 153 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 C3orf49Q96BT1 292 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 PROCRQ9UNN8 238 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 C1QBP02746 253 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 POU2F2P09086 479 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK5Q00535 292 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF117Q03924 483 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 PXT1Q8NFP0 134 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 NEU3Q9UQ49 428 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 NXPH3O95157 252 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 GLAP06280 429 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 EPXP11678 715 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 AADACP22760 399 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB11AP62491 216 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 TAF9Q16594 264 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 CTF1Q16619 201 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB109BQ30KR1 87 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 RDH5Q92781 318 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 C20orf141Q9NUB4 165 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 BTN1A1Q13410 526 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2KP61086 200 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 FAAP20Q6NZ36 180 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 TMUB2Q71RG4 321 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 AP1S3Q96PC3 154 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 AKIP1Q9NQ31 210 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 ELFN2Q5R3F8 820 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 DERL3Q96Q80 235 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 GLI4P10075 376 aa19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.4 ms