RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNA1HO95180 2353 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GTI1 187 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 WIPF3A6NGB9 483 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM25EA8MYX2 175 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CD8AP01732 235 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
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SH3BP1-202ENST00000417536 LUMP51884 338 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 PNLIPRP2P54317 469 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF273Q14593 569 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52W1Q6IF63 320 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 GUSBP11Q6P575 273 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ATRAIDQ6UW56 229 aa16.67■□□□□ 0.26
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SH3BP1-202ENST00000417536 FGGYQ96C11 551 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZDHHC12Q96GR4 267 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL5BQ96KC2 179 aa16.67■□□□□ 0.26
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SH3BP1-202ENST00000417536 COMMD9Q9P000 198 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
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SH3BP1-202ENST00000417536 IGHMP01871 453 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 GNALP38405 381 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMYND11Q15326 602 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
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SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 OR1L3Q8NH93 324 aa16.66■□□□□ 0.26
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SH3BP1-202ENST00000417536 PMEPA1Q969W9 287 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF75AQ96N20 296 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A32Q9H2D1 315 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTD2Q9H8S5 307 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 MED29Q9NX70 200 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0D9SG52 128 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 DISC1C4P0D8 188 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BMH7 237 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TO15178 435 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
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SH3BP1-202ENST00000417536 FGL1Q08830 312 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 OR7A5Q15622 319 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ELP2Q6IA86 826 aa16.66■□□□□ 0.26
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SH3BP1-202ENST00000417536 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 LDAHQ9H6V9 325 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 UCK1Q9HA47 277 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa16.65■□□□□ 0.26
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SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 MS4A18H0YCH9 400 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2T1O43869 369 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CD37P11049 281 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CAPZA1P52907 286 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 MS4A18Q3C1V0 323 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf100Q5SVJ3 147 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf87Q6NUJ2 197 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CST11Q9H112 138 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 NPIPA1Q9UND3 350 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL21EPA6NDL7 271 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 FTCDNL1E5RQL4 147 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 H2BFMP0C1H6 154 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CTRB1P17538 263 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP1B3P54709 279 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R1AQ13522 171 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CTRB2Q6GPI1 263 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 RHOUQ7L0Q8 258 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNRGQ8N5I3 272 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 RASL12Q9NYN1 266 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 GLS2Q9UI32 602 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFSF18Q9UNG2 199 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ARID1AO14497 2285 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 RTTNQ86VV8 2226 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0A6YYH2 397 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OR14I1A6ND48 311 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 A6NJ64 397 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB27BO00194 218 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ISG15P05161 165 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 NAGAP17050 411 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF260Q3ZCT1 412 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM244Q5VVB8 128 aa16.64■□□□□ 0.25
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