RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384526.1

RNU6-880P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 880, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-880P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-880P-201ENST00000384526 PLIN3O60664 434 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 THRAP10827 490 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 DDOSTP39656 456 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC35A2P78381 396 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 TCP10Q12799 353 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 CST6Q15828 149 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 CARTPTQ16568 116 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 MAPK6Q16659 721 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 Q5VV11 94 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 DHRSXQ8N5I4 330 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 ACOT4Q8N9L9 421 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR2Z1Q8NG97 314 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR10D4PQ8NGN7 298 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 DCANP1Q8TF63 244 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 CHMP4AQ9BY43 222 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 PROK2Q9HC23 129 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 CYP39A1Q9NYL5 469 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 AIPL1Q9NZN9 384 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 HMGXB4Q9UGU5 601 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 TBK1Q9UHD2 729 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 COPS3Q9UNS2 423 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 LIPT1Q9Y234 373 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 MAGI2Q86UL8 1455 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 A0A0B4J2A0 478 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 K7EQZ3 153 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 TM7SF2O76062 418 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC22A5O76082 557 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 PAHP00439 452 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SPINK1P00995 79 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 IFNAR1P17181 557 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 PGCP20142 388 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 ERVK-25P63136 954 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 CDH17Q12864 832 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 CUL2Q13617 745 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM201AQ5SY85 155 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 MFSD4BQ5TF39 518 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 C16orf87Q6PH81 154 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 FNDC5Q8NAU1 212 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 NTAN1Q96AB6 310 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 DTD2Q96FN9 168 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 C12orf66Q96MD2 445 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 NPY6RQ99463 290 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 EDEM2Q9BV94 578 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 DPH5Q9H2P9 285 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 ANKRA2Q9H9E1 313 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM49BQ9NUQ9 324 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 TP73-AS1Q9UF72 201 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SUN2Q9UH99 717 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SHPKQ9UHJ6 478 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 CTNNA3Q9UI47 895 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 PLXNA2O75051 1894 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 MSH6P52701 1360 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 REREQ9P2R6 1566 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 ALKQ9UM73 1620 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 ADAMTSL3P82987 1691 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SMIM30A4D0T7 59 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARHGAP42A6NI28 874 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 GPR89AB7ZAQ6 455 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 PALMO75781 387 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 MFN2O95140 757 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 GPR89BP0CG08 455 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF43P17038 809 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 RORAP35398 523 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 EIF1P41567 113 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 MAGEA12P43365 314 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLCO1A2P46721 670 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 DEFB1P60022 68 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 OGDHQ02218 1023 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SCRN3Q0VDG4 424 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 KLHL40Q2TBA0 621 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 LINC01620Q4KN68 170 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 LUZP6Q538Z0 58 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SPINK6Q6UWN8 80 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 UTS2BQ765I0 119 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 KIAA1328Q86T90 577 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SYCP3Q8IZU3 236 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR10A7Q8NGE5 316 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 VSTM2LQ96N03 204 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-880P-201ENST00000384526 SPZ1Q9BXG8 430 aa-1.26□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.7 ms