RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 H3BN98 237 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 IFNL4K9M1U5 179 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 E2F6O75461 281 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 PYCR1P32322 319 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 MVKQ03426 396 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 ACSM5Q6NUN0 579 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 CFAP77Q6ZQR2 320 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 LINC00346Q8IVM7 164 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 OR2Z1Q8NG97 314 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 OR13G1Q8NGZ3 307 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 OR51F2Q8NH61 342 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 POFUT1Q9H488 388 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 NARFLQ9H6Q4 476 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 CMC2Q9NRP2 79 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 ARMC1Q9NVT9 282 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TREM2Q9NZC2 230 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 PTTG3PQ9NZH4 202 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 POMPQ9Y244 141 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TLN2Q9Y4G6 2542 aa16.06■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 SOX14O95416 240 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 MSMBP08118 114 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 ACSM4P0C7M7 580 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 ANXA8P13928 327 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 GRK5P34947 590 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 LMO4P61968 165 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 CRMP1Q14194 572 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TEX30Q5JUR7 227 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TEX29Q8N6K0 151 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 OR8G5Q8NG78 346 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 OR4Q3Q8NH05 313 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TEX12Q9BXU0 123 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF665Q9H7R5 613 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 DNAJB9Q9UBS3 223 aa16.05■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TRAV20A0A0B4J274 112 aa16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 GSC2O15499 205 aa16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 LCATP04180 440 aa16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 HMGN1P05114 100 aa16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 SPI1P17947 270 aa16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 PAICSP22234 425 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 ENTPD1P49961 510 aa16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 BNIP1Q12981 228 aa16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 AVPI1Q5T686 147 aa16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM186Q96B77 213 aa16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 IQCF6A8MYZ5 107 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 M0R135 149 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 FKBP6O75344 327 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 OSMP13725 252 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 SRP9P49458 86 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 CBX1P83916 185 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TAF13Q15543 124 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 PCK2Q16822 640 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 OR2T2Q6IF00 324 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 DRAM2Q6UX65 266 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 Q6ZR03 302 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 NRBF2Q96F24 287 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF799Q96GE5 643 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 MAP6Q96JE9 813 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 GAL3ST1Q99999 423 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM106BQ9NUM4 274 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM100Q9NV29 134 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 HIF1ANQ9NWT6 349 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 CACNG2Q9Y698 323 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa16.03■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 TVP23AA6NH52 213 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 WNT9BO14905 357 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 SPARCP09486 303 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 SRP14P37108 136 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 SLC15A1P46059 708 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 DCXRQ7Z4W1 244 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 OR6K6Q8NGW6 343 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 SLC22A4Q9H015 551 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 SP140LQ9H930 580 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 NPTNQ9Y639 398 aa16.02■□□□□ 0.16
MALSU1-201ENST00000287543 RTTNQ86VV8 2226 aa16.01■□□□□ 0.15
MALSU1-201ENST00000287543 FAM157AC9JC47 383 aa16.01■□□□□ 0.15
MALSU1-201ENST00000287543 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MALSU1-201ENST00000287543 IGHV2-5P01817 119 aa16.01■□□□□ 0.15
MALSU1-201ENST00000287543 APOC1P02654 83 aa16.01■□□□□ 0.15
MALSU1-201ENST00000287543 POU1F1P28069 291 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms