RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 POU3F4P49335 361 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.64□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 RAET1LQ5VY80 246 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 OR52N5Q8NH56 324 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 SGK3Q96BR1 496 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 POM121Q96HA1 1249 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 SEC14L5O43304 696 aa14.64□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 SC5DO75845 299 aa14.64□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 C1orf198Q9H425 327 aa14.64□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 RNF224P0DH78 156 aa14.63□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 C4orf47A7E2U8 309 aa14.63□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.63□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.63□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.63□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 GPR31O00270 319 aa14.63□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 FABP9Q0Z7S8 132 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 CLLU1Q5K131 121 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 RNF128Q8TEB7 428 aa14.63□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 CTDSPLO15194 276 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 ZNF208O43345 1280 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 CER1O95813 267 aa14.62□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 TMEM205Q6UW68 189 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 FAM46BQ96A09 425 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 EMC6Q9BV81 110 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 MED29Q9NX70 200 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 OR2J2O76002 312 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 TPOP07202 933 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 HCKP08631 526 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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