RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp180Q6NZI9 655 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Phf21aQ6ZPK0 659 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp748Q7TPL6 888 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1463Q7TQR3 310 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr787Q7TRI1 312 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mogat2Q80W94 334 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zdhhc25Q810M4 279 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P4htmQ8BG58 503 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nudt9Q8BVU5 350 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Steap2Q8BWB6 489 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NraddQ8CJ26 228 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 B4galt7Q8R087 327 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tspan10Q8VCF5 331 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr593Q8VF28 327 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr98Q8VFD9 309 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr99Q8VFE4 305 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1052Q8VGR8 312 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Egln3Q91UZ4 239 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MallQ91X49 154 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hrh4Q91ZY2 391 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Glyr1Q922P9 546 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 D730048I06RikQ9CQB8 106 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rab3bQ9CZT8 219 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acp1Q9D358 158 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Keg1Q9DCY0 295 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acox3Q9EPL9 700 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr937Q9EQB4 311 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf207Q9JMD0 495 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam89bQ9QUI1 189 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tbl2Q9R099 442 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Htra1Q9R118 480 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adam11Q9R1V4 773 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ch25hQ9Z0F5 298 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Padi1Q9Z185 662 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col5a1O88207 1838 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ckap5A2AGT5 2032 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MyofQ69ZN7 2048 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptprz1B9EKR1 2312 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp735B1ARH2 734 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm14744B1AVU4 173 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr547E9PXN3 311 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8127E9Q0P0 100 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm6465F7A7Y6 181 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8094K7N6U8 211 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8906L7N2A2 181 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hsd17b12O70503 312 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10881P01642 115 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Csf1P07141 552 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mst1P26928 716 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Agtr1bP29755 359 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rfx3P48381 749 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hsd11b1P50172 292 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 S100a11P50543 98 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rac1P63001 192 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpinf1P97298 417 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GnrhrQ01776 327 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Clpsl2Q3UW21 102 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AccslQ3UX83 580 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mtcp1Q60945 107 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Il10rbQ61190 349 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rpa2Q62193 270 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nptx1Q62443 432 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nox3Q672J9 568 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim45Q6PFY8 580 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cpeb3Q7TN99 716 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ticam1Q80UF7 732 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SetmarQ80UJ9 309 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr70Q80ZX9 316 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SargQ8BI29 606 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LsampQ8BLK3 341 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ssuh2Q8C3L1 340 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ScaiQ8C8N2 606 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cml2Q8CHQ9 238 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r23Q8R2D0 302 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r17Q8R2D8 303 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr460Q8VF31 314 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr825Q8VFU7 320 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prss42Q8VIF2 335 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chchd6Q91VN4 273 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Basp1Q91XV3 226 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scgb3a1Q920D7 104 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NepnQ9CQ76 512 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdc42ep3Q9CQC5 254 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrps14Q9CR88 128 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CrtapQ9CYD3 400 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q9CYS6 286 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 5430402E10RikQ9D3N5 173 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Med11Q9D8C6 117 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ctag2Q9D9S4 219 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc107Q9DCC3 242 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr887Q9EQA6 309 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim39Q9ESN2 488 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nox4Q9JHI8 578 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Yipf7Q9JIM5 254 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serinc1Q9QZI8 453 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serinc3Q9QZI9 472 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Npas3Q9QZQ0 925 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Uchl1Q9R0P9 223 aa8.29□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdcd1lg2Q9WUL5 247 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.8 ms