Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Nptx1Q62443 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nptx1Q62443 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nptx1Q62443 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nptx1Q62443 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Nptx1Q62443 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nptx1Q62443 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nptx1Q62443 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nptx1Q62443 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nptx1Q62443 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nptx1Q62443 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nptx1Q62443 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Nptx1Q62443 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nptx1Q62443 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nptx1Q62443 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nptx1Q62443 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nptx1Q62443 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nptx1Q62443 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nptx1Q62443 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nptx1Q62443 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nptx1Q62443 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nptx1Q62443 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nptx1Q62443 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nptx1Q62443 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nptx1Q62443 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nptx1Q62443 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Nptx1Q62443 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nptx1Q62443 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nptx1Q62443 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nptx1Q62443 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nptx1Q62443 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nptx1Q62443 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nptx1Q62443 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nptx1Q62443 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nptx1Q62443 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Nptx1Q62443 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nptx1Q62443 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nptx1Q62443 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nptx1Q62443 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Nptx1Q62443 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nptx1Q62443 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nptx1Q62443 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nptx1Q62443 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nptx1Q62443 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nptx1Q62443 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nptx1Q62443 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nptx1Q62443 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Nptx1Q62443 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nptx1Q62443 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nptx1Q62443 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nptx1Q62443 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nptx1Q62443 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nptx1Q62443 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nptx1Q62443 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nptx1Q62443 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nptx1Q62443 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nptx1Q62443 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nptx1Q62443 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nptx1Q62443 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nptx1Q62443 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nptx1Q62443 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nptx1Q62443 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nptx1Q62443 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nptx1Q62443 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nptx1Q62443 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nptx1Q62443 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Nptx1Q62443 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nptx1Q62443 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nptx1Q62443 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nptx1Q62443 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nptx1Q62443 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nptx1Q62443 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nptx1Q62443 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nptx1Q62443 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nptx1Q62443 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nptx1Q62443 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nptx1Q62443 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nptx1Q62443 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nptx1Q62443 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nptx1Q62443 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nptx1Q62443 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nptx1Q62443 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nptx1Q62443 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nptx1Q62443 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nptx1Q62443 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nptx1Q62443 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nptx1Q62443 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nptx1Q62443 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nptx1Q62443 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nptx1Q62443 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nptx1Q62443 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nptx1Q62443 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nptx1Q62443 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nptx1Q62443 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nptx1Q62443 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nptx1Q62443 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nptx1Q62443 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nptx1Q62443 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nptx1Q62443 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nptx1Q62443 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms