Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan10Q8VCF5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,79■■■■□ 3,16
Tspan10Q8VCF5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Tspan10Q8VCF5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Tspan10Q8VCF5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,51■■■□□ 2,47
Tspan10Q8VCF5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Tspan10Q8VCF5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
Tspan10Q8VCF5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Tspan10Q8VCF5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Tspan10Q8VCF5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Tspan10Q8VCF5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tspan10Q8VCF5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Tspan10Q8VCF5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Tspan10Q8VCF5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Tspan10Q8VCF5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Tspan10Q8VCF5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Tspan10Q8VCF5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Tspan10Q8VCF5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tspan10Q8VCF5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tspan10Q8VCF5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tspan10Q8VCF5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tspan10Q8VCF5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tspan10Q8VCF5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Tspan10Q8VCF5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Tspan10Q8VCF5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tspan10Q8VCF5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Tspan10Q8VCF5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Tspan10Q8VCF5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Tspan10Q8VCF5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Tspan10Q8VCF5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Tspan10Q8VCF5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Tspan10Q8VCF5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Tspan10Q8VCF5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Tspan10Q8VCF5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Tspan10Q8VCF5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Tspan10Q8VCF5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Tspan10Q8VCF5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Tspan10Q8VCF5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Tspan10Q8VCF5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Tspan10Q8VCF5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Tspan10Q8VCF5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Tspan10Q8VCF5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tspan10Q8VCF5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Tspan10Q8VCF5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tspan10Q8VCF5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Tspan10Q8VCF5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Tspan10Q8VCF5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Tspan10Q8VCF5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Tspan10Q8VCF5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Tspan10Q8VCF5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
Tspan10Q8VCF5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Tspan10Q8VCF5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Tspan10Q8VCF5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tspan10Q8VCF5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Tspan10Q8VCF5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Tspan10Q8VCF5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Tspan10Q8VCF5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Tspan10Q8VCF5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Tspan10Q8VCF5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Tspan10Q8VCF5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tspan10Q8VCF5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Tspan10Q8VCF5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Tspan10Q8VCF5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Tspan10Q8VCF5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Tspan10Q8VCF5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Tspan10Q8VCF5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Tspan10Q8VCF5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Tspan10Q8VCF5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Tspan10Q8VCF5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tspan10Q8VCF5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
Tspan10Q8VCF5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Tspan10Q8VCF5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Tspan10Q8VCF5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
Tspan10Q8VCF5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Tspan10Q8VCF5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tspan10Q8VCF5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tspan10Q8VCF5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Tspan10Q8VCF5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tspan10Q8VCF5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,76
Tspan10Q8VCF5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Tspan10Q8VCF5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tspan10Q8VCF5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Tspan10Q8VCF5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Tspan10Q8VCF5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Tspan10Q8VCF5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Tspan10Q8VCF5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Tspan10Q8VCF5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Tspan10Q8VCF5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Tspan10Q8VCF5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Tspan10Q8VCF5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tspan10Q8VCF5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Tspan10Q8VCF5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tspan10Q8VCF5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tspan10Q8VCF5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Tspan10Q8VCF5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Tspan10Q8VCF5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Tspan10Q8VCF5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Tspan10Q8VCF5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tspan10Q8VCF5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tspan10Q8VCF5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Tspan10Q8VCF5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
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