RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 RER1O15258 196 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 SGCEO43556 437 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CRHBPP24387 322 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 STOMP27105 288 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 FMO3P31513 532 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 HIST1H3AP68431 136 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 C20orf204Q6ZNR8 217 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 HIST2H3AQ71DI3 136 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 OR6K6Q8NGW6 343 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CNIH3Q8TBE1 160 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 POM121L2Q96KW2 1035 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 WDR76Q9H967 626 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 RTTNQ86VV8 2226 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 SLC1A7O00341 560 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 GLCEO94923 617 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 ATE1O95260 518 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 INHBBP09529 407 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 DANCRP0C864 163 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 PSKH1P11801 424 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF823P16415 610 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 GABRB1P18505 474 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CD53P19397 219 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 NR4A1P22736 598 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 APLNRP35414 380 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 RPS27P42677 84 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 OCLNQ16625 522 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 SLC18B1Q6NT16 456 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 KCTD8Q6ZWB6 473 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CDH24Q86UP0 819 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 NUP37Q8NFH4 326 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CDADC1Q9BWV3 514 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 PRODHO43272 600 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 WBP4O75554 376 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 RAF1P04049 648 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 SOD3P08294 240 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 SLC2A5P22732 501 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 BLVRAP53004 296 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 ADAM8P78325 824 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 KLHL12Q53G59 568 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 GJC3Q8NFK1 279 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 OR1J2Q8NGS2 313 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM163Q8TC26 289 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 IGFBPL1Q8WX77 278 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 UBE2FQ969M7 185 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CDH20Q9HBT6 801 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CA10Q9NS85 328 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 PLEK2Q9NYT0 353 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 KCNG2Q9UJ96 466 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 C5orf49A4QMS7 147 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 SYNGR3O43761 229 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 DOK2O60496 412 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 FAM20BO75063 409 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 COX5BP10606 129 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CCNOP22674 350 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 ENTPD1P49961 510 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 FABP6P51161 128 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 TMED1Q13445 227 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 PCK2Q16822 640 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 TBC1D15Q8TC07 691 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 APH1BQ8WW43 257 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 RFKQ969G6 155 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 COX4I2Q96KJ9 171 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 IL4I1Q96RQ9 567 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 MARCH7Q9H992 704 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 EDARQ9UNE0 448 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 VPS13CQ709C8 3753 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-208ENST00000566059 OR6C6A6NF89 314 aa15.46■□□□□ 0.06
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
SPNS1-208ENST00000566059 CD8AP01732 235 aa15.46■□□□□ 0.06
SPNS1-208ENST00000566059 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
SPNS1-208ENST00000566059 THBS4P35443 961 aa15.46■□□□□ 0.06
SPNS1-208ENST00000566059 HTR5AP47898 357 aa15.46■□□□□ 0.06
SPNS1-208ENST00000566059 GDI2P50395 445 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
SPNS1-208ENST00000566059 GALK2Q01415 458 aa15.46■□□□□ 0.06
SPNS1-208ENST00000566059 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms