RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 ABHD13Q7L211 337 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 OR52E2Q8NGJ4 325 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC39Q96DD0 335 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 CD209Q9NNX6 404 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 ALKQ9UM73 1620 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC22A20A6NK97 555 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 TDP2O95551 362 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 DCNP07585 359 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC172P0C7W6 258 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF17P17021 662 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 NMUP48645 174 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 CSNK1DP48730 415 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF138P52744 262 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 CRISP3P54108 245 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 XIAPP98170 497 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 TCP10Q12799 353 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 CDH17Q12864 832 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A25Q6KCM7 469 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 RPEQ96AT9 228 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 EFCAB5A4FU69 1503 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2R1Q13018 1463 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF861PO60384 105 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 FABP3P05413 133 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ATF6P18850 670 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ELK1P19419 428 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB3BP20337 219 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CCNE1P24864 410 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 HMGCS1Q01581 520 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 PIGGQ5H8A4 983 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ASCL4Q6XD76 172 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ITFG1Q8TB96 612 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 TCP10LQ8TDR4 215 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CREB3L1Q96BA8 519 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 DYNLL2Q96FJ2 89 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 MCUBQ9NWR8 336 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 IFNKQ9P0W0 207 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CD84Q9UIB8 345 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 A6NDN8 102 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 GABRPO00591 440 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 NME4O00746 187 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 MPDU1O75352 247 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 IVLP07476 585 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 TACSTD2P09758 323 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CASQ1P31415 396 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CEACAM3P40198 252 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CEACAM6P40199 344 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CDKN2BP42772 138 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CXCL5P42830 114 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB7AP51149 207 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CCNG1P51959 295 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 POU2AF1Q16633 256 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO48Q5FWF7 155 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 HORMAD1Q86X24 394 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM71AQ8IYT1 594 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ARRDC1Q8N5I2 433 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF185Q96GF1 192 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 PSG8Q9UQ74 426 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 STK38LQ9Y2H1 464 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 RICTORQ6R327 1708 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 MROH7Q68CQ1 1323 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 LAD1O00515 517 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC19A2O60779 497 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-205ENST00000514178 HPRT1P00492 218 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms