RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513436.6

SERF1A-209, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, human

TSL 3 BASIC

Gene SERF1A, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1A-209	ENST00000513436	VWC2L	B2RUY7	222 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	TGFA	P01135	160 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	LCK	P06239	509 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	FAM157C	P0CG43	387 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	PGA4	P0DJD7	388 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	PGA3	P0DJD8	388 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ZNF35	P13682	527 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	TGFBR2	P37173	567 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	AQP2	P41181	271 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	TMBIM6	P55061	237 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	IRF3	Q14653	427 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	MCHR2	Q969V1	340 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	C1orf198	Q9H425	327 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	AMBN	Q9NP70	447 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	TMEM160	Q9NX00	188 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	GPR160	Q9UJ42	338 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	CR1	P17927	2039 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	RNF212B	A8MTL3	300 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	CDK1	P06493	297 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	HNF1A	P20823	631 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	POU1F1	P28069	291 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	SLC15A1	P46059	708 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	OMP	P47874	163 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	HSF2	Q03933	536 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	TRAM2	Q15035	370 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	LRRC18	Q8N456	261 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	CENPBD1	B2RD01	187 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	GABARAP	O95166	117 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	IGF2	P01344	180 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	NR2C1	P13056	603 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ALDH3B1	P43353	468 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	CDC42	P60953	191 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	SPCS2	Q15005	226 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	CTF1	Q16619	201 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	RRM2B	Q7LG56	351 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	LINC00471	Q8N535	108 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ASB10	Q8WXI3	467 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ZNF75A	Q96N20	296 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	RBP7	Q96R05	134 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ENTPD6	O75354	484 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	FAM157B	P0CG42	384 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	IFI30	P13284	250 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	CCL2	P13500	99 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	CCNO	P22674	350 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	APLNR	P35414	380 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	RAD52	P43351	418 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	CSNK2B	P67870	215 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	RUNX1T1	Q06455	604 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	SGCA	Q16586	387 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ALG10	Q5BKT4	473 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	SVOP	Q8N4V2	548 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SERF1A-209	ENST00000513436	RORB	Q92753	470 aa		10.48	□□□□□ -0.73

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