RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 DISC1C4P0D8 188 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB27BO00194 218 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF273Q14593 569 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 PCK2Q16822 640 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 C11orf87Q6NUJ2 197 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 WDFY1Q8IWB7 410 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF441Q8N8Z8 693 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 OR10K1Q8NGX5 313 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 OR1L3Q8NH93 324 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 CENPMQ9NSP4 180 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 CCSO14618 274 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 LTBRP36941 435 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ARL4DP49703 201 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 HSD11B2P80365 405 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 MEF2DQ14814 521 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNRGQ8N5I3 272 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 CMBLQ96DG6 245 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ARL5BQ96KC2 179 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 PRRT1Q99946 306 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 RASL12Q9NYN1 266 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 TNFSF18Q9UNG2 199 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 CTRB1P17538 263 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB6AP20340 208 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 FBLP22087 321 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 CD38P28907 300 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF260Q3ZCT1 412 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 CTRB2Q6GPI1 263 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB12Q6IQ22 244 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF813Q6ZN06 617 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 FJX1Q86VR8 437 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 FGGYQ96C11 551 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 VN1R1Q9GZP7 353 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB33BQ9H082 229 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 COMMD9Q9P000 198 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB22AQ9UL26 194 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM200CA6NKL6 621 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 TDGQ13569 410 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 C5orf46Q6UWT4 87 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC25A42Q86VD7 318 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 GVQW1Q8N7I0 195 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ASB10Q8WXI3 467 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC2A8Q9NY64 477 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 C2orf72A6NCS6 295 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 A6NIZ1 184 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 RHPN2P1A8MT19 583 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 NPIPA5E9PKD4 350 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 APOC3P02656 99 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 NAGAP17050 411 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 RAP1BP61224 184 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 RAP1AP62834 184 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF345Q14585 488 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf189Q5VU69 101 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 DNM1P34Q6PK57 102 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 DEGS2Q6QHC5 323 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 NPIPA1Q9UND3 350 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 CPED1A4D0V7 1026 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ADAM10O14672 748 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2F2O95006 317 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 H2BFMP0C1H6 154 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ZBTB25P24278 435 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2F1Q13607 317 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 OR7A5Q15622 319 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC22A6Q4U2R8 563 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 BEX5Q5H9J7 111 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 LANCL3Q6ZV70 420 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 CHST4Q8NCG5 386 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 MRGPRFQ96AM1 343 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNK17Q96T54 332 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 CST11Q9H112 138 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 MED29Q9NX70 200 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 ASXL3Q9C0F0 2248 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC25A4P12235 298 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 STARP49675 285 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 MMP16P51512 607 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 LUMP51884 338 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 CAPZA1P52907 286 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 PHF19Q5T6S3 580 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 OR52W1Q6IF63 320 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM234Q8WY98 164 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM46BQ96A09 425 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1B0GW55 424 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 DUX4L2P0CJ85 424 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-221ENST00000511747 DUX4L3P0CJ86 424 aa24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms