RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 DHRS12A0PJE2 317 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 AQP12BA6NM10 295 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 WNT9BO14905 357 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CST1P01037 141 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 TUBG1P23258 451 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 LIPAP38571 399 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CRYBB2P43320 205 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 SLC36A3Q495N2 470 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 SLC18B1Q6NT16 456 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 AQP12AQ8IXF9 295 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 LINC01356Q8N9X3 169 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CANT1Q8WVQ1 401 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 DDOQ99489 341 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 TUBG2Q9NRH3 451 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 LPAR3Q9UBY5 353 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CACNG2Q9Y698 323 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 TANC2Q9HCD6 1990 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 ADH4P08319 380 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 PYCR1P32322 319 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 RGS6P49758 472 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CDH15P55291 814 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 FLOT2Q14254 428 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 IL17RELQ6ZVW7 336 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 LNX2Q8N448 690 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 SLC37A3Q8NCC5 494 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 OR4Q3Q8NH05 313 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CMBLQ96DG6 245 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 ELMOD3Q96FG2 381 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 C1orf159Q96HA4 380 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 COG8Q96MW5 612 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 KLHL21Q9UJP4 597 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 J3QW42 95 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 FAM157CP0CG43 387 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 KITLGP21583 273 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 GGT2P36268 569 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 ERFP50548 548 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 GK3PQ14409 553 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 FAM120AOSQ5T036 256 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 AVPI1Q5T686 147 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 OR2T33Q8NG76 320 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 OR2T4Q8NH00 348 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 GIPC3Q8TF64 312 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 DIRC2Q96SL1 478 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 PITX2Q99697 317 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CDADC1Q9BWV3 514 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 EGLN1Q9GZT9 426 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 TREM2Q9NZC2 230 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 PTTG3PQ9NZH4 202 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CLDN25C9JDP6 229 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CD55P08174 381 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 MVKQ03426 396 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CRMP1Q14194 572 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 HFEQ30201 348 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 SPRNQ5BIV9 151 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CD300LDQ6UXZ3 194 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 SPATA24Q86W54 205 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 ZNRF4Q8WWF5 429 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 HAVCR1Q96D42 359 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 FEVQ99581 238 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 ATF6BQ99941 703 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 KCNG2Q9UJ96 466 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 COL6A5A8TX70 2615 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 ARRDC5A6NEK1 342 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 TVP23AA6NH52 213 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 FAM157AC9JC47 383 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 GNGT2O14610 69 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 IFNA2P01563 188 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 RAC2P15153 192 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF823P16415 610 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 HNF1AP20823 631 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 RPS27P42677 84 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 CDK5R2Q13319 367 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXD11-202ENST00000498438 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms