RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SBNO1A3KN83 1393 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AGRNO00468 2067 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ERI3O43414 337 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NPIPB7O75200 414 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TDP2O95551 362 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LY6G6DO95868 133 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGHV4-34P06331 123 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD1EP15812 388 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATF6P18850 670 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BGNP21810 368 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD9P21926 228 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IL32P24001 234 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZBTB25P24278 435 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYB561P49447 251 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HMGCS1Q01581 520 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSC22D1Q15714 1073 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GABRA6Q16445 453 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GUCA2BQ16661 112 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATP6V1FQ16864 119 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 COX15Q7KZN9 410 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM71AQ8IYT1 594 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KIF2BQ8N4N8 673 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LINC01006Q8NI28 216 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACTRT1Q8TDG2 376 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZFP90Q8TF47 636 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NRBF2Q96F24 287 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNF170Q96K19 258 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD84Q9UIB8 345 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GMEB1Q9Y692 573 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AK9Q5TCS8 1911 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FHOD3Q2V2M9 1422 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NFASCO94856 1347 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYCE1LA8MT33 242 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NME4O00746 187 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RFXANKO14593 260 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TNFSF13O75888 250 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLEKHA8P1O95397 391 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGLV1-47P01700 117 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RHOCP08134 193 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR8U9P0C7N5 309 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ERGP11308 486 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAB3AP20336 220 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OMGP23515 440 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PFN2P35080 140 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FABP6P51161 128 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATP6V0D1P61421 351 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZSCAN26Q16670 478 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C6orf183Q5T699 404 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF621Q6ZSS3 439 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRSS58Q8IYP2 241 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DCAF4L2Q8NA75 395 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR8U1Q8NH10 309 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DNAJC19Q96DA6 116 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CEP170P1Q96L14 293 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR2M2Q96R28 347 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NRTNQ99748 197 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AGMATQ9BSE5 352 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF302Q9NR11 478 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF225Q9UK10 706 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATRXP46100 2492 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAP3K19Q56UN5 1328 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR6C74A6NCV1 312 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 H7C2Y5 167 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 VAPBO95292 243 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 YEATS4O95619 227 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACTL6AO96019 429 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FABP3P05413 133 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GLAP06280 429 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCL2P13500 99 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CEACAM3P40198 252 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CEACAM6P40199 344 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPR4P46093 362 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 P2RX1P51575 399 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UCNP55089 124 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC35B1P78383 322 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC7A9P82251 487 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 XIAPP98170 497 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GINS1Q14691 196 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PON3Q15166 354 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANGPT1Q15389 498 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FHL5Q5TD97 284 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms