RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365563.1

RNU6-54P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 54, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-54P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-54P-201ENST00000365563 MSH6P52701 1360 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 OTOFQ9HC10 1997 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 COL6A3P12111 3177 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 GABRR3A8MPY1 467 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 WASH3PC4AMC7 463 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 STX7O15400 261 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 DUX1O43812 170 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CDH16O75309 829 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SEMA3DO95025 777 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 OPN1SWP03999 348 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CD3GP09693 182 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RPA2P15927 270 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RAB3AP20336 220 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SERPINB6P35237 376 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 NBL1P41271 181 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 KCNJ1P48048 391 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 HCCSP53701 268 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 HSPA2P54652 639 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 GFERP55789 205 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MYBPC1Q00872 1141 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 IRF8Q02556 426 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CDK5R1Q15078 307 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PTPRKQ15262 1439 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 NNATQ16517 81 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TMEM95Q3KNT9 176 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PTPN20Q4JDL3 420 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 IFI44LQ53G44 452 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 Q5BKY6 102 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SPINK9Q5DT21 86 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TIMM23BQ5SRD1 257 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CCNJQ5T5M9 372 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 WASH2PQ6VEQ5 465 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TUSC5Q8IXB3 177 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CLYBLQ8N0X4 340 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF283Q8N7M2 679 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CCDC89Q8N998 374 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MSANTD4Q8NCY6 345 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR10A7Q8NGE5 316 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR4D6Q8NGJ1 314 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TEKT1Q969V4 418 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 NUDT9Q9BW91 350 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ANKRD2Q9GZV1 360 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 REEP4Q9H6H4 257 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CYP3A43Q9HB55 503 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 UFSP2Q9NUQ7 469 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RDH8Q9NYR8 311 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAD2L2Q9UI95 211 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 VAX2Q9UIW0 290 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SNURFQ9Y675 71 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 NCKAP5O14513 1909 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 APC2O95996 2303 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 FRMPD4Q14CM0 1322 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 EML5Q05BV3 1969 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 A0A0D9SG42 100 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 A0A1W2PRG6 482 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ARRDC5A6NEK1 342 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 NPIPA7E9PJI5 369 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 FFAR1O14842 300 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RS1O15537 224 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 TOM1L1O75674 476 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 FARS2O95363 451 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 UTS2O95399 124 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 H2BFMP0C1H6 154 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 NPIPA8P0DM63 369 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 AREGP15514 252 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ATF1P18846 271 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 KITLGP21583 273 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 PCMT1P22061 227 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC2A5P22732 501 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 F2RP25116 425 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CHMLP26374 656 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ELK4P28324 431 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 P2RX1P51575 399 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 RELAQ04206 551 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 CARTPTQ16568 116 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZSCAN26Q16670 478 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF678Q5SXM1 525 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-54P-201ENST00000365563 SPATA1Q5VX52 437 aa-0.86□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms