RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNFSF13O75888 250 aa20.96■□□□□ 0.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GLI4P10075 376 aa20.96■□□□□ 0.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYL9P24844 172 aa20.96■□□□□ 0.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAV3P56539 151 aa20.96■□□□□ 0.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCK2Q16822 640 aa20.96■□□□□ 0.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR3A2P47893 321 aa20.95■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDFY2Q96P53 400 aa20.95■□□□□ 0.94
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR2A2Q6IF42 318 aa20.94■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PARP16Q8N5Y8 322 aa20.94■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FRRS1LQ9P0K9 344 aa20.94■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LHFPL6Q9Y693 200 aa20.94■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COL6A6A6NMZ7 2263 aa20.94■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF84P51523 738 aa20.94■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PMPCAQ10713 525 aa20.94■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FDX2Q6P4F2 183 aa20.94■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR10H5Q8NGA6 315 aa20.94■□□□□ 0.94
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FOXB1Q99853 325 aa20.94■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC30A2Q9BRI3 323 aa20.94■□□□□ 0.94
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR52N5Q8NH56 324 aa20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATF6BQ99941 703 aa20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCB9Q9NP78 766 aa20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ASH2LQ9UBL3 628 aa20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa20.92■□□□□ 0.94
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TIMP3P35625 211 aa20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IFITM3Q01628 133 aa20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNMB1Q16558 191 aa20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDI2Q5TDH0 399 aa20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LAX1Q8IWV1 398 aa20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR6K3Q8NGY3 331 aa20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ST7LQ8TDW4 575 aa20.92■□□□□ 0.94
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MALT1Q9UDY8 824 aa20.92■□□□□ 0.94
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