RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 GLRX2Q9NS18 164 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 HHLA2Q9UM44 414 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 EPXP11678 715 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 THBS2P35442 1172 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ASB5Q8WWX0 329 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 DHDHQ9UQ10 334 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 OR14I1A6ND48 311 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 K7EM74 188 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 WISP2O76076 250 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 TTRP02766 147 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 CD2P06729 351 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 B4GALT1P15291 398 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 PRKXP51817 358 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 PCBD1P61457 104 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF627Q7L945 461 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ORAI1Q96D31 301 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SH3GL3Q99963 347 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SLC19A2O60779 497 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 APOC1P02654 83 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ACSM4P0C7M7 580 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 AGTR1P30556 359 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 PSMD7P51665 324 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ECH1Q13011 328 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 RAB35Q15286 201 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 TBR1Q16650 682 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 GFI1Q99684 422 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 BRD7Q9NPI1 651 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 UPB1Q9UBR1 384 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 LHX6Q9UPM6 363 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 V9GY05 133 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 CACNA1CQ13936 2221 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 AHRRA9YTQ3 701 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SGCEO43556 437 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 HPGDSO60760 199 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 IGHV3-9P01782 118 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 CX3CR1P49238 355 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 UCNP55089 124 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 V9GYH0 126 aa14.73□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 IFITM5A6NNB3 132 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 H3BSH0 61 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 AIPO00170 330 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 P2RY10O00398 339 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SYNGR3O43761 229 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ADRA2CP18825 462 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ATF1P18846 271 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 FSTP19883 344 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 EVX1P49640 407 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 GALK2Q01415 458 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SKA3Q8IX90 412 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms