RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rad51ap1Q8C551 337 aa26.79■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Swsap1Q8VCI7 278 aa26.79■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1277Q8VF41 303 aa26.79■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rprd1bQ9CSU0 326 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trav10nA0A075B622 114 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trav6-7-dv9A0A075B639 125 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trav10A0A075B642 114 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 IghdA0A0A6YW14 291 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm4131A0A140LJ24 318 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppp1r3dA2AJW4 279 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr294F7CWV4 335 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trav13d-3J3QMG8 112 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Thbs3Q05895 956 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MitfQ08874 526 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ptp4a1Q63739 173 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc35f2Q7TML3 375 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NelfaQ8BG30 530 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc7a6Q8BGK6 515 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mrpl48Q8JZS9 211 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trim13Q9CYB0 407 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kbtbd6E9PYD7 486 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm17555F6U8B9 371 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Foxk1P42128 719 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Crabp1P62965 137 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc7a10P63115 530 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm10696Q3UTC4 357 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Foxg1Q60987 481 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tssk1bQ61241 365 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ReltQ8BX43 436 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ScaiQ8C8N2 606 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 4933402N03RikQ8CDT9 329 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr561Q8VGZ6 314 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dppa5aQ9CQS7 118 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PacrgQ9DAK2 241 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Isoc2bQ9DCC7 210 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr934Q9EQ87 310 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ifi30Q9ESY9 248 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PigfO09101 219 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hoxb2P0C1T1 354 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdh3P10287 822 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spag8Q3V0Q6 470 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmco6Q8BQX5 494 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr800Q8VFH7 311 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NifkQ91VE6 317 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc35a5Q921R7 437 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tnfaip8Q921Z5 198 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppp1r35Q9D8C8 260 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Samd8Q9DA37 478 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nrip3Q9JJR9 240 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PrnA0A075B668 197 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rps2-ps6A0A140T8L5 221 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1215A3KGY3 312 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm17093F6XGJ4 214 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr724K7N5X7 309 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Stc2O88452 296 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Il10P18893 178 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr90Q0VEL5 310 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q3U1D9 316 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HinfpQ8K1K9 503 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cnih4Q9CX13 139 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wwp2Q9DBH0 870 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PrndQ9QUG3 179 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TinagQ9WUR0 475 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp68Q9Z116 606 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdk10Q3UMM4 360 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nkain3Q3URJ8 181 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Srsf1Q6PDM2 248 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mogat2Q80W94 334 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 St3gal4Q91Y74 333 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dgat1Q9Z2A7 498 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Skint10A7TZG1 354 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp707F6QUN2 391 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdhr4H3BJZ2 783 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pdlim3O70209 316 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Alox12bO70582 701 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P04946 108 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Milr1Q3TB92 246 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dcdc2Q5DU00 475 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tsr3Q5HZH2 323 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mblac1Q8BWY4 260 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr825Q8VFU7 320 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1054Q8VGS7 312 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Clic3Q9D7P7 237 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kat2aQ9JHD2 830 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dopey1Q8BL99 2399 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dock9Q8BIK4 2055 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm21750L7N228 499 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lire1P11260 357 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cbr1P48758 277 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Opn1swP51491 346 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc2a6Q3UDF0 497 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp52Q8BJ45 724 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bmt2Q8BXK4 403 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NdnfQ8C119 568 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cuedc1Q8R3V6 388 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Desi1Q9CQT7 168 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fnd3c2A2AP83 941 aa26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.6 ms