RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MiipA2A7Y5 387 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1314A2AVL6 312 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Skint4A7TZF3 474 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krtap4-2B1AQ85 167 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem229aB9EJI9 371 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3636E9Q5P1 227 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp760E9QAF5 666 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm42421F6X8D5 166 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm19345G3UYD9 124 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2j8G3UZ38 503 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r12G5E8G1 307 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r28L7N203 852 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm20939L7N243 523 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prkar1bP12849 381 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PpibP24369 216 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lyl1P27792 278 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Alox5apP30355 161 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sirt6P59941 334 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tbx5P70326 518 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HfeP70387 359 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PkibQ04758 92 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nr4a2Q06219 598 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc35f3Q1LZI2 421 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10750Q3V0I0 133 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r196Q5SVD5 301 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klk8Q61955 260 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Svs6Q64356 99 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc6a7Q6PGE7 637 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hsh2dQ6VYH9 334 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1349Q7TQV1 317 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1281Q7TQY6 305 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pgm2Q7TSV4 620 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc34a3Q80SU6 601 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gadl1Q80WP8 550 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TiprlQ8BH58 271 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rgp1Q8BHT7 391 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxw14Q8C2Y5 466 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam120cQ8C3F2 1091 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Micu2Q8CD10 432 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hpf1Q8CFE2 346 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 1700001C19RikQ8K168 210 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Anapc10Q8K2H6 185 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Crtac1Q8R555 646 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem242Q8VCR3 140 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr215Q8VF82 310 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1254Q8VFB1 314 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr826Q8VFU6 313 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r43Q8VIC9 329 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MrgprdQ91ZB8 321 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gorasp2Q99JX3 451 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lactb2Q99KR3 288 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arl4dQ99PE9 201 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myl9Q9CQ19 172 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pop4Q9CR08 221 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pfn4Q9D6I3 129 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pmepa1Q9D7R2 260 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Med8Q9D7W5 268 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arpc5lQ9D898 153 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr934Q9EQ87 310 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr888Q9EQA5 314 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BvesQ9ES83 358 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GnmtQ9QXF8 293 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf346Q9R0B7 294 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klf5Q9Z0Z7 446 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SvilQ8K4L3 2170 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trbc1A0A0A6YWV4 173 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Igkv9-124A0A0G2JDR3 117 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Igkv6-14A0A140T8P1 115 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trav12-2A0N8N6 114 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stpg3A2RSX4 306 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm266A6H634 200 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ifit3bE9PV48 403 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nr1h5E9Q5A6 505 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 2610001J05RikF2Z3Y9 59 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r167G3UW71 315 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem178bM0QWJ9 172 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CrygsO35486 178 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prl7a1O54830 266 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01680 129 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01852 173 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TpbpaP13438 124 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gdf1P20863 357 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sftpa1P35242 248 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Id4P41139 161 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CdaP56389 146 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cldn18P56857 264 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd59bP58019 129 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hrh3P58406 445 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PrkacbP68181 351 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nos3P70313 1202 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ucp2P70406 309 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FapP97321 761 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cass4Q08EC4 804 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Entpd6Q3U0P5 455 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MeikinQ5F2C3 434 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Csnk2a1Q60737 391 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc34a1Q60825 637 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HepacamQ640R3 418 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptpmt1Q66GT5 193 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60.5 ms