Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Cldn18P56857 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cldn18P56857 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cldn18P56857 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cldn18P56857 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cldn18P56857 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cldn18P56857 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cldn18P56857 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cldn18P56857 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cldn18P56857 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cldn18P56857 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cldn18P56857 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cldn18P56857 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cldn18P56857 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cldn18P56857 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cldn18P56857 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cldn18P56857 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cldn18P56857 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cldn18P56857 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cldn18P56857 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cldn18P56857 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cldn18P56857 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cldn18P56857 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cldn18P56857 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cldn18P56857 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cldn18P56857 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cldn18P56857 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cldn18P56857 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cldn18P56857 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cldn18P56857 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cldn18P56857 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cldn18P56857 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cldn18P56857 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cldn18P56857 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cldn18P56857 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cldn18P56857 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cldn18P56857 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cldn18P56857 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cldn18P56857 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cldn18P56857 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cldn18P56857 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cldn18P56857 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cldn18P56857 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cldn18P56857 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cldn18P56857 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cldn18P56857 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cldn18P56857 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cldn18P56857 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cldn18P56857 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cldn18P56857 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cldn18P56857 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cldn18P56857 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cldn18P56857 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cldn18P56857 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cldn18P56857 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cldn18P56857 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cldn18P56857 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cldn18P56857 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cldn18P56857 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cldn18P56857 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cldn18P56857 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cldn18P56857 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cldn18P56857 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cldn18P56857 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cldn18P56857 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cldn18P56857 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cldn18P56857 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cldn18P56857 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cldn18P56857 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cldn18P56857 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cldn18P56857 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cldn18P56857 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cldn18P56857 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cldn18P56857 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cldn18P56857 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn18P56857 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cldn18P56857 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cldn18P56857 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldn18P56857 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cldn18P56857 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldn18P56857 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn18P56857 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn18P56857 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cldn18P56857 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cldn18P56857 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cldn18P56857 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cldn18P56857 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldn18P56857 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cldn18P56857 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cldn18P56857 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cldn18P56857 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cldn18P56857 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cldn18P56857 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cldn18P56857 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cldn18P56857 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cldn18P56857 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cldn18P56857 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cldn18P56857 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cldn18P56857 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cldn18P56857 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms