RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004430.13

Clcn3-201, Transcript of H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clcn3, Length 4,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc25a40Q8BGP6 337 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zc3h12dQ8BIY3 533 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmem222Q8BVA2 208 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gtdc1Q8BW56 445 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Snx18Q91ZR2 614 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Senp8Q9D2Z4 221 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Bola1Q9D8S9 137 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1076A2AK60 313 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm21818J3KMS6 170 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm21972J3QN38 98 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm21767J3QPV5 180 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm5458L7N219 204 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Nipsnap1O55125 284 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp1P08042 402 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 TaglnP37804 201 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 G6pd2P97324 513 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mex3dQ3UE17 643 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1216Q7TR05 311 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fbxw13Q8BI57 466 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc43a2Q8CGA3 568 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Plekho2Q8K124 495 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Nsun5Q8K4F6 465 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmem45bQ8VCZ2 278 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 2210010C04RikQ9CPN9 247 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fam219aQ9D772 157 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Spsb2O88838 264 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 P06336 421 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rps27aP62983 156 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Uba52P62984 128 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hes3Q61657 175 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr479Q7TRV1 327 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rhox11Q810N8 206 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr461Q8VF30 313 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Sp7Q8VI67 428 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Vmn1r172Q9EPS4 313 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hebp2Q9WU63 205 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Plxna3P70208 1872 aa11.66□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm44973A0A140LJJ1 189 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp352A2AML7 551 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 BC048679D3YXE9 172 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm8225D3Z536 292 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp160E9Q459 650 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 EdaO54693 391 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Bpifa2P07743 235 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gja4P28235 333 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tacr1P30548 407 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ceacam19Q3TQ88 271 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr843Q7TRG4 313 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Nsun3Q8CCT7 348 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fbxo4Q8CHQ0 385 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 St8sia6Q8K4T1 398 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Il34Q8R1R4 235 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr860Q8VFF7 317 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Znf524Q9D0B1 321 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pex13Q9D0K1 405 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Znf346Q9R0B7 294 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fam90a1aA2A4E2 429 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm13102A2ASJ3 519 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cldn20G5E8X0 219 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm8024L7N2E0 100 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Bloc1s1O55102 125 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 RoraP51448 523 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Galr1P56479 348 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Vamp2P63044 116 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Col10a1Q05306 680 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 ArsjQ8BM89 598 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rdh16f2Q8K3M1 318 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Defb36Q8K3U4 67 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tspan10Q8VCF5 331 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr60Q8VGL4 311 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Acss1Q99NB1 682 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc52a3Q9D6X5 460 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Adamts5Q9R001 930 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc22a5Q9Z0E8 557 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Plxnb3Q9QY40 1902 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ckap5A2AGT5 2032 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm15737D3YZR0 106 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ninj1O70131 152 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tgfb1P04202 390 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Itga5P11688 1053 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pou3f3P31361 497 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rab3aP63011 220 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 SnrpnP63163 240 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 SgcaP82350 387 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 6430531B16RikQ3V2J1 307 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Adam26bQ6IMH6 699 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Spin2cQ6NVE3 257 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Camk2dQ6PHZ2 499 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tas2r116Q7M713 305 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr201Q7TS38 308 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 B430218F22RikQ8BQR5 223 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr849Q8VFF6 312 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr678Q8VG26 313 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Spred2Q924S7 410 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Dnttip1Q99LB0 328 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Nudcd2Q9CQ48 157 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ndufa6Q9CQZ5 131 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gfod2Q9CYH5 385 aa11.65□□□□□ -0.54
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Scn8aQ9WTU3 1978 aa11.65□□□□□ -0.55
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm34653A0A1L1SR01 368 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43 ms