Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB0

Dnttip1, Deoxynucleotidyltransferase terminal-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnttip1Q99LB0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Dnttip1Q99LB0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dnttip1Q99LB0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnttip1Q99LB0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnttip1Q99LB0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dnttip1Q99LB0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnttip1Q99LB0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dnttip1Q99LB0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dnttip1Q99LB0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnttip1Q99LB0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnttip1Q99LB0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnttip1Q99LB0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Dnttip1Q99LB0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnttip1Q99LB0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dnttip1Q99LB0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnttip1Q99LB0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnttip1Q99LB0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnttip1Q99LB0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnttip1Q99LB0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Dnttip1Q99LB0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dnttip1Q99LB0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnttip1Q99LB0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnttip1Q99LB0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnttip1Q99LB0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dnttip1Q99LB0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnttip1Q99LB0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnttip1Q99LB0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnttip1Q99LB0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnttip1Q99LB0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnttip1Q99LB0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnttip1Q99LB0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnttip1Q99LB0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnttip1Q99LB0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnttip1Q99LB0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnttip1Q99LB0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnttip1Q99LB0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnttip1Q99LB0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnttip1Q99LB0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnttip1Q99LB0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnttip1Q99LB0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnttip1Q99LB0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnttip1Q99LB0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnttip1Q99LB0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnttip1Q99LB0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnttip1Q99LB0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnttip1Q99LB0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnttip1Q99LB0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnttip1Q99LB0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnttip1Q99LB0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnttip1Q99LB0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnttip1Q99LB0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnttip1Q99LB0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnttip1Q99LB0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnttip1Q99LB0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnttip1Q99LB0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnttip1Q99LB0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnttip1Q99LB0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnttip1Q99LB0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnttip1Q99LB0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnttip1Q99LB0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnttip1Q99LB0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnttip1Q99LB0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnttip1Q99LB0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnttip1Q99LB0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnttip1Q99LB0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnttip1Q99LB0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnttip1Q99LB0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnttip1Q99LB0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnttip1Q99LB0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnttip1Q99LB0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnttip1Q99LB0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnttip1Q99LB0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnttip1Q99LB0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnttip1Q99LB0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnttip1Q99LB0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnttip1Q99LB0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnttip1Q99LB0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dnttip1Q99LB0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnttip1Q99LB0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnttip1Q99LB0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnttip1Q99LB0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnttip1Q99LB0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Dnttip1Q99LB0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnttip1Q99LB0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnttip1Q99LB0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnttip1Q99LB0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnttip1Q99LB0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnttip1Q99LB0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnttip1Q99LB0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnttip1Q99LB0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnttip1Q99LB0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnttip1Q99LB0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnttip1Q99LB0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnttip1Q99LB0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnttip1Q99LB0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnttip1Q99LB0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dnttip1Q99LB0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnttip1Q99LB0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnttip1Q99LB0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnttip1Q99LB0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms