RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SVILO95425 2214 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 UMAD1C9J7I0 102 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFS4O43181 175 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 FAM46CQ5VWP2 391 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 PHYHIPQ92561 330 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 MVB12AQ96EY5 273 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 TPSD1Q9BZJ3 242 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SYT4Q9H2B2 425 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 METTL12A8MUP2 240 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 OGG1O15527 345 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 CTAG2O75638 210 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 C1QL1O75973 258 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ITGA5P08648 1049 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 PI3P19957 117 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 PDX1P52945 283 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 S100A10P60903 97 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 TGM3Q08188 693 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 EID2Q8N6I1 236 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 CLEC1AQ8NC01 280 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF563Q8TA94 476 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 PATE1Q8WXA2 126 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ASB16Q96NS5 453 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 RNF126Q9BV68 326 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 MS4A8Q9BY19 250 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 TUBA4BQ9H853 241 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 MGAQ8IWI9 3026 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 MARCH11A6NNE9 402 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 MFNGO00587 321 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R2P9O14990 202 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 KLF4O43474 513 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 XRCC3O43542 346 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 RAMP1O60894 148 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 EFEMP2O95967 443 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 CD5P06127 495 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 FCGR3AP08637 254 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 PAX6P26367 422 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 PSMB6P28072 239 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 CRABP1P29762 137 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 BSGP35613 385 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 CARFQ8N187 725 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 NTNG2Q96CW9 530 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 CMC2Q9NRP2 79 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 ICKQ9UPZ9 632 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 POLEQ07864 2286 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 AIFM1O95831 613 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 WNT11O96014 354 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 TRGC2P03986 189 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 PRNPP04156 253 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 CXCL1P09341 107 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 AK4P27144 223 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 DECR1Q16698 335 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 GKN2Q86XP6 184 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 CXorf40AQ8TE69 158 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 CYYR1Q96J86 154 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 TSSK2Q96PF2 358 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 BCO1Q9HAY6 547 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-211ENST00000618610 CLDND1Q9NY35 253 aa7.39□□□□□ -1.23
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