RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	PMP2	P02689	132 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	PRR35	P0CG20	571 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	OR1C1	Q15619	314 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	OR2L13	Q8N349	312 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	OR4C3	Q8NH37	302 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SERPINA7	P05543	415 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	PRKACA	P17612	351 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SSTR2	P30874	369 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	CCR9	P51686	369 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SHE	Q5VZ18	495 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	GPR119	Q8TDV5	335 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	LUZP4	Q9P127	313 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	HS3ST1	O14792	307 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	CLDN1	O95832	211 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	B4GALT1	P15291	398 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	HES1	Q14469	280 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	PCK2	Q16822	640 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	RDH10	Q8IZV5	341 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	OR52N5	Q8NH56	324 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151		A0A087WUJ7	227 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	XRCC2	O43543	280 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SULT1C4	O75897	302 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	TGM4	P49221	684 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	EGR3	Q06889	387 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	KCNJ15	Q99712	375 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	FAM157B	P0CG42	384 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	ALDH3B1	P43353	468 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	KIR2DL3	P43628	341 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	RAB5B	P61020	215 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151		A8MXE2	369 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	LINC01387	J3KSC0	135 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	NPY4R	P50391	375 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	HBG1	P69891	147 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	HBG2	P69892	147 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	S100A12	P80511	92 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	FAHD1	Q6P587	224 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	POC1B	Q8TC44	478 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	EDAR	Q9UNE0	448 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	TBX19	O60806	448 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	NRAS	P01111	189 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	CALCB	P10092	127 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	S100A7	P31151	101 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	KIAA0040	Q15053	153 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SSX3	Q99909	188 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151		A0A0U1RQK1	487 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	RPA2	P15927	270 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	ECI1	P42126	302 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	FABP6	P51161	128 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	AMER3	Q8N944	861 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	SPACA5	Q96QH8	159 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RAB18-208	ENST00000611151	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41

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