RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1B0GW15	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909		E9PLD3	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	AQP9	O43315	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PLIN3	O60664	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SCGN	O76038	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	LRAT	O95237	230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	H6PD	O95479	791 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CST4	P01036	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	IFNA21	P01568	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CRYGB	P07316	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GTF2F2	P13984	249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ETS2	P15036	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	UGT2B10	P36537	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACOT2	P49753	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TPMT	P51580	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CDC42	P60953	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NAA20	P61599	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PAX2	Q02962	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FGL1	Q08830	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ASAH1	Q13510	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	LAGE3	Q14657	143 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPA17	Q15506	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	COX19	Q49B96	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SBK1	Q52WX2	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	HGD	Q93099	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PFDN5	Q99471	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARL5A	Q9Y689	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909		M0QZ92	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCRL2	O00421	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PHYH	O14832	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC16A4	O15374	487 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	UPK3A	O75631	287 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCNE2	O96020	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	UCHL3	P15374	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SERPINA2	P20848	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GABRR1	P24046	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PAX6	P26367	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCR7	P32248	378 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	EPHX2	P34913	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CEACAM6	P40199	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	BTD	P43251	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CYB561	P49447	251 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PAX5	Q02548	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MGAT3	Q09327	533 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	AQP6	Q13520	282 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RUNX3	Q13761	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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