RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570484.1

CTDNEP1-204, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 393 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-204ENST00000570484 PAX7P23759 505 aa5.76□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 RIDAP52758 137 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 TAS2R43P59537 309 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 GRB2P62993 217 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 ECH1Q13011 328 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 MED22Q15528 200 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 TSC22D1Q15714 1073 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 TEX30Q5JUR7 227 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 TIMM23BQ5SRD1 257 aa5.76□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 STAC2Q6ZMT1 411 aa5.76□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR52N1Q8NH53 320 aa5.76□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNRF4Q8WWF5 429 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 FCGR1BQ92637 280 aa5.76□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 S100PBPQ96BU1 408 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLAMF6Q96DU3 332 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 C4orf36Q96KX1 117 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 JAM3Q9BX67 310 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 DUSP21Q9H596 190 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC17A5Q9NRA2 495 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 ERVK-18Q9QC07 812 aa5.76□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.76□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF254O75437 659 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 APOC1P02654 83 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 HSMCR30P0CW71 290 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF19P17023 458 aa5.75□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 PSMB9P28065 219 aa5.75□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 UGT2B10P36537 528 aa5.75□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 CDH15P55291 814 aa5.75□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 PCK2Q16822 640 aa5.75□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDNEP1-204ENST00000570484 TP53I3Q53FA7 332 aa5.75□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa5.75□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 MDP1Q86V88 176 aa5.75□□□□□ -1.49
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CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.75□□□□□ -1.49
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