RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517230.1

RNA5SP47-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 47, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP47, Length 109 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP47-201ENST00000517230 OR5H8P0DN80 308 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ETS1P14921 441 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TNNI3P19429 210 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 FUT1P19526 365 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 MUTP22033 750 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 PRKACBP22694 351 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CHMLP26374 656 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 P2RX1P51575 399 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TPMTP51580 245 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 UGT2B15P54855 530 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TAS2R43P59537 309 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 RPL23P62829 140 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ACTG2P63267 376 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ECH1Q13011 328 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CBX3Q13185 183 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 C1orf61Q13536 156 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 DOC2AQ14183 400 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ARHGAP19Q14CB8 494 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 DPYSL2Q16555 572 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 KLHL38Q2WGJ6 581 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 XKR7Q5GH72 579 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 LRRC8BQ6P9F7 803 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CCDC80Q76M96 950 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CATSPER4Q7RTX7 472 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 DHDDSQ86SQ9 333 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 NUDCD3Q8IVD9 361 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 MSRB3Q8IXL7 192 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 LIX1Q8N485 282 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 COX18Q8N8Q8 333 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 FAM133AQ8N9E0 248 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 B3GNT7Q8NFL0 401 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 OR4M1Q8NGD0 313 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 OR4D5Q8NGN0 318 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 OR1J4Q8NGS1 313 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 C10orf105Q8TEF2 133 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZNF606Q8WXB4 792 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 UBE2E3Q969T4 207 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ATP6V1E2Q96A05 226 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TMEM186Q96B77 213 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 PIK3IP1Q96FE7 263 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CABS1Q96KC9 395 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 C7orf34Q96L11 122 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZNF75AQ96N20 296 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SERPINB12Q96P63 405 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 HIGD2AQ9BW72 106 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 NUDT9Q9BW91 350 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 LRRC19Q9H756 370 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 VSIRQ9H7M9 311 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TUBA4BQ9H853 241 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 MID1IP1Q9NPA3 183 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 UFSP2Q9NUQ7 469 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 HMGXB4Q9UGU5 601 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 PCSK1NQ9UHG2 260 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SLC7A8Q9UHI5 535 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ST3GAL6Q9Y274 331 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 GBF1Q92538 1859 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 RGS12O14924 1447 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 MED13Q9UHV7 2174 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 PALLDQ8WX93 1383 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 UBE4BO95155 1302 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SMIM26A0A096LP01 95 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 A0A1B0GVL5 298 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 GGTLC3B5MD39 225 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 G3V3Q6 166 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CLDN3O15551 220 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 HCRTO43612 131 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TIMM44O43615 452 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 PSCAO43653 123 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 LANCL1O43813 399 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SCGB2A1O75556 95 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SERPINB7O75635 380 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 PALMO75781 387 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 GATBO75879 557 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SCO1O75880 301 aa-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms