RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC19A2O60779 497 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PRAF2O60831 178 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CSTAP01040 98 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MT-ND4LP03901 98 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CD3GP09693 182 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXO45P0C2W1 286 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LIPCP11150 499 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NQO2P16083 231 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CNR1P21554 472 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MST1P26927 711 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OTX2P32243 289 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 THBS4P35443 961 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CRYBB2P43320 205 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC6A8P48029 635 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 EVX1P49640 407 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PRKXP51817 358 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZP1P60852 638 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PLAURQ03405 335 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OCLNQ16625 522 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ST3GAL2Q16842 350 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GXYLT1Q4G148 440 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MOB3CQ70IA8 216 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MRGPREQ86SM8 312 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CDK20Q8IZL9 346 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SPICQ8N5J4 248 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF614Q8N883 585 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4C3Q8NH37 302 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LMF1Q96S06 567 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ADOQ96SZ5 270 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GINS4Q9BRT9 223 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LAT2Q9GZY6 243 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RLIMQ9NVW2 624 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PCSK5Q92824 1860 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TPST2O60704 377 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAP00813 363 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SERPINA7P05543 415 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HOXB5P09067 269 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SPARCP09486 303 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HOXA5P20719 270 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HTR2AP28223 471 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 THBS2P35442 1172 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GGT2P36268 569 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 IFNGR2P38484 337 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RBX1P62877 108 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 BLOC1S1P78537 153 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NPRL3Q12980 569 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MED22Q15528 200 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1Q1Q15612 314 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NTRK2Q16620 822 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GSG1Q2KHT4 349 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MZT2AQ6P582 158 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OPN5Q6U736 354 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR22Q8IZ63 422 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5T1Q8NG75 326 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NEK7Q8TDX7 302 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MALSU1Q96EH3 234 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SEC11CQ9BY50 192 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PPE3 182 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CDC14CA4D256 554 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF264O43296 627 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FRS3O43559 492 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FZD7O75084 574 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TFP02787 698 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TCRBP04435 133 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms