RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 HLA-DMAP28067 261 aa14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 SRD5A2P31213 254 aa14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 CYB561P49447 251 aa14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 KCNJ8Q15842 424 aa14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 RAB11BQ15907 218 aa14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 OR52I2Q8NH67 350 aa14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 LMX1BO60663 402 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 PSMF1Q92530 271 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 BEX2Q9BXY8 128 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 STMN3Q9NZ72 180 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 GLTPQ9NZD2 209 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 KNTC1P50748 2209 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 GABARAPH6UMI1 98 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 VAMP5O95183 116 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 WDPCPO95876 746 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 MT-ND4P03905 459 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 PTHLHP12272 177 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 ENPP1P22413 925 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 CSNK1A1P48729 337 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 SCAND1P57086 179 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 GPR87Q9BY21 358 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 NUDT15Q9NV35 164 aa14.84□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 GJE1A6NN92 205 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 ZNF878C9JN71 531 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 SLC17A2O00624 439 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 SULT1B1O43704 296 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 ACSM4P0C7M7 580 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 FSTP19883 344 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 GIFP27352 417 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 HSD11B1P28845 292 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 POU3F4P49335 361 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 TAS2R20P59543 309 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 GABREP78334 506 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 TAF13Q15543 124 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 HES3Q5TGS1 186 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 LUZP2Q86TE4 346 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 KCNK15Q9H427 330 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 NEK6Q9HC98 313 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 DEPPQ9NTK1 212 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.83□□□□□ -0.03
TOM1-216ENST00000492723 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 TRAPPC6AO75865 159 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 KRT33AO76009 404 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 TTRP02766 147 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 ARSBP15848 533 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 CFPP27918 469 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 EFNB2P52799 333 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 CD83Q01151 205 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 SPOCK1Q08629 439 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 SPEM2Q0P670 501 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 SGCAQ16586 387 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 OR2M2Q96R28 347 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 KLK11Q9UBX7 282 aa14.83□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 TTLL8A6PVC2 850 aa14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 C21orf140B9A014 251 aa14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 RER1O15258 196 aa14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 NR2C1P13056 603 aa14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 DCTDP32321 178 aa14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 CCR6P51684 374 aa14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 ZFP69Q49AA0 526 aa14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 RCE1Q9Y256 329 aa14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 TCRBP04435 133 aa14.82□□□□□ -0.04
TOM1-216ENST00000492723 PRKXP51817 358 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms