RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	C1RL	Q9NZP8	487 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM129	A0AVI4	362 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRP5L	A4QPB2	252 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CFAP73	A6NFT4	308 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CLDN24	A6NM45	220 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941		A8MVM7	634 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941		B4DSR2	109 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	HMGN4	O00479	90 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	AP3D1	O14617	1153 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRT33A	O76009	404 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	AKR7A3	O95154	331 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	LGI1	O95970	557 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGKV3-15	P01624	115 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPI	P06744	558 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	NUDT17	P0C025	328 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CECR9	P0C854	216 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CBR1	P16152	277 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL7R	P16871	459 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ITGA2	P17301	1181 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	NPR2	P20594	1047 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CXCR1	P25024	350 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CALCR	P30988	508 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARR3	P36575	388 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	EVX1	P49640	407 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	P2RY4	P51582	365 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDH15	P55291	814 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	HPCA	P84074	193 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	FUT5	Q11128	374 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	EPS8	Q12929	822 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CEACAM7	Q14002	265 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GNA13	Q14344	377 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CASP8	Q14790	479 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR7A5	Q15622	319 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPAT3	Q53EU6	434 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM225	Q6GV28	225 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPAT4	Q86UL3	456 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKRD46	Q86W74	232 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKFN1	Q8N957	763 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	AGR3	Q8TD06	166 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TESC	Q96BS2	214 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	NEURL3	Q96EH8	262 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	APOPT1	Q96IL0	206 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	LITAF	Q99732	161 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	DPY30	Q9C005	99 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RASD1	Q9Y272	281 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941		A0A096LPI6	279 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM89	A2RUT3	159 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CBY3	A6NI87	242 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SMIM23	A6NLE4	172 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	NR5A2	O00482	541 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	NPIPB7	O75200	414 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	UPK3A	O75631	287 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	VENTX	O95231	258 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	BPGM	P07738	259 aa		3.36	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms